More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1414 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1414  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2431  two component transcriptional regulator  98.67 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  61.75 
 
 		 220 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  53.21 
 
 		 227 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  53.67 
 
 		 227 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  54.38 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2759  two-component response regulator  53.21 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3935  two component transcriptional regulator  52.75 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32580  two-component response regulator  52.75 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2791  two component transcriptional regulator  54.17 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  46.26 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.41 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.41 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.41 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  49.53 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  46.54 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1358  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  46.79 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2384  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00270522  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  191  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0933  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 253 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  43.98 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.84 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.73 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.15 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  43.52 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.52 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  45.37 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.29 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.08 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.08 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.08 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.08 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.08 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  46.3 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  46.3 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  46.3 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  46.3 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  46.3 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  46.3 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.84 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  46.3 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  43.84 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  43.84 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.84 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.84 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.84 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  48.11 
 
 		 283 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  45.79 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  46.5 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  46.5 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>