More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2384 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2384  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  437  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00270522  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1358  two component transcriptional regulator  92.34 
 
 		 222 aa  411  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  55.76 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  55.3 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  55.3 
 
 		 227 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  55.3 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32580  two-component response regulator  54.38 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2759  two-component response regulator  53.92 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  52.53 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3935  two component transcriptional regulator  52.53 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2791  two component transcriptional regulator  56.94 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  47.03 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 233 aa  201  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  46.58 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.47 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 222 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.93 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2754  two-component system response regulator  47.95 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.864218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  49.31 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  49.31 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.91 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.91 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.91 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.54 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.07 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  49.31 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.47 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.47 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  49.31 
 
 		 220 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.47 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.47 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.47 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  46.54 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  46.54 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.54 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.54 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  48.84 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 220 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 220 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1939  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.07 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.08 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.08 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 283 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1414  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  44.44 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2431  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4906  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.91 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.37 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.66 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  50.46 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  46.26 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 227 aa  178  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>