More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6539 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6539  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  77.27 
 
 		 229 aa  200  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  62.02 
 
 		 233 aa  154  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  48.59 
 
 		 231 aa  137  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.74 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  55.74 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2129  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.24 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  52.46 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  51.64 
 
 		 227 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 237 aa  127  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 237 aa  127  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  51.85 
 
 		 225 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  50.82 
 
 		 227 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  51.11 
 
 		 225 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  47.76 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  47.76 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  47.76 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  47.76 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  47.69 
 
 		 237 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.69 
 
 		 237 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  50.82 
 
 		 233 aa  124  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  50.82 
 
 		 228 aa  124  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  49.18 
 
 		 227 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.18 
 
 		 227 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 227 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  48.8 
 
 		 233 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  48.89 
 
 		 227 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  48.53 
 
 		 226 aa  121  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 227 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  43.55 
 
 		 240 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 		 240 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.14 
 
 		 259 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  43.55 
 
 		 246 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  45.9 
 
 		 227 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  41.89 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1865  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  41.55 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  39.37 
 
 		 224 aa  107  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 230 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 228 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  41.1 
 
 		 228 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  41.6 
 
 		 233 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0620  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 229 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  47.29 
 
 		 223 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  47.29 
 
 		 272 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.15 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3245  DNA-binding response regulator  46.96 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.124036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 237 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  40.82 
 
 		 220 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3091  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.63 
 
 		 224 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 236 aa  103  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  37.91 
 
 		 224 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.77 
 
 		 223 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  44.6 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.31 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  39.31 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  42.03 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  46.61 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3276  DNA-binding response regulator  39.35 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 224 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2676  DNA-binding response regulator  39.35 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0042  DNA-binding response regulator  39.35 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1851  DNA-binding response regulator  39.35 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0255  DNA-binding response regulator  39.35 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2701  DNA-binding response regulator  39.35 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0042  DNA-binding response regulator  39.35 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  46.83 
 
 		 233 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 225 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0039  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 225 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 221 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 263 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 246 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 236 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.53 
 
 		 224 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  46.61 
 
 		 229 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  40.8 
 
 		 231 aa  101  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 		 228 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  38.97 
 
 		 227 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.16 
 
 		 230 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 219 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 221 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 221 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.93 
 
 		 225 aa  100  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 225 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 221 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  43.7 
 
 		 260 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  40.54 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  43.7 
 
 		 260 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  43.7 
 
 		 260 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 260 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  40.54 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  38.41 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>