More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0638 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  59.91 
 
 
688 aa  805    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  93.09 
 
 
745 aa  1405    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  58.27 
 
 
698 aa  745    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  52.37 
 
 
676 aa  674    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  54.29 
 
 
726 aa  721    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  52.14 
 
 
686 aa  708    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  92.43 
 
 
745 aa  1397    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  54.98 
 
 
687 aa  723    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  60.58 
 
 
688 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  62.5 
 
 
719 aa  830    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  93.36 
 
 
749 aa  1409    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  86.74 
 
 
713 aa  1188    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  61.91 
 
 
710 aa  819    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  87.77 
 
 
710 aa  1201    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  54.34 
 
 
684 aa  723    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 
753 aa  1536    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  87.31 
 
 
687 aa  1197    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  52.86 
 
 
681 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  52.21 
 
 
676 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  93.23 
 
 
749 aa  1398    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  59.91 
 
 
688 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  64.56 
 
 
724 aa  915    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  85.93 
 
 
710 aa  1180    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  85.93 
 
 
710 aa  1180    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  92.43 
 
 
745 aa  1397    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  59.6 
 
 
688 aa  799    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  53.18 
 
 
669 aa  683    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  53 
 
 
681 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  85.93 
 
 
710 aa  1180    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  92.43 
 
 
745 aa  1397    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  57.93 
 
 
725 aa  747    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  87.31 
 
 
709 aa  1194    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  62.65 
 
 
723 aa  834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  46.14 
 
 
691 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  45.39 
 
 
686 aa  544  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  40.03 
 
 
661 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.41 
 
 
662 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  40.19 
 
 
667 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  39.35 
 
 
668 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  39.35 
 
 
668 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 
668 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  37.88 
 
 
663 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  36.57 
 
 
667 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  32.54 
 
 
695 aa  300  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 
672 aa  260  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.81 
 
 
665 aa  239  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 
697 aa  233  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 
699 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
668 aa  187  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
768 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.37 
 
 
699 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 
702 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 
702 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 
681 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
702 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 
673 aa  142  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
760 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 
661 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 
698 aa  106  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 
793 aa  103  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 
696 aa  103  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 
716 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 
684 aa  101  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 
775 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 
780 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 
751 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
751 aa  90.9  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 
681 aa  89.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
698 aa  89.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
718 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
692 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
698 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
698 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 
681 aa  89.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 
685 aa  89.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 
725 aa  89  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
721 aa  87.4  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 
677 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  31.1 
 
 
764 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 
741 aa  84.7  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 
742 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 
769 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  31.42 
 
 
764 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
683 aa  84  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
677 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
693 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.95 
 
 
625 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 
744 aa  82  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 
724 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
694 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.55 
 
 
861 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.94 
 
 
775 aa  77  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 
713 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 
706 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  24.62 
 
 
772 aa  75.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  52.24 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 
705 aa  74.7  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  24.24 
 
 
681 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  20.35 
 
 
713 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 
682 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.503749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>