More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3171 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3171  phytoene dehydrogenase, putative  100 
 
 		 488 aa  952    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  22.87 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.61 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  29.84 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  26.65 
 
 		 511 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  28.71 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.65 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.2 
 
 		 511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.99 
 
 		 553 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  25.86 
 
 		 512 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  25.86 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  28.43 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  26.21 
 
 		 522 aa  113  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 506 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  27.46 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  25.1 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.75 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.21 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  26.35 
 
 		 505 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 516 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  29.26 
 
 		 508 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  26.14 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  26.41 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 524 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  26.81 
 
 		 503 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 502 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  25.42 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  27.81 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  28.4 
 
 		 509 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  29.1 
 
 		 508 aa  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  30 
 
 		 525 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 564 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.78 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.46 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  27.76 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  27.76 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 518 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 506 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  25.3 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 497 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  24.24 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 497 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  26.89 
 
 		 507 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  23.58 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  26.83 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  29.1 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 547 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  27.36 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.07 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  26.47 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  25.3 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  26.31 
 
 		 492 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  27.17 
 
 		 504 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  26.92 
 
 		 518 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  23.48 
 
 		 520 aa  100  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  27.4 
 
 		 519 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  28.85 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  21.71 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 565 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  21.41 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 554 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 563 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 493 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  28.48 
 
 		 508 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  27.67 
 
 		 506 aa  97.4  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  28.84 
 
 		 494 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  27.72 
 
 		 492 aa  97.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  28.04 
 
 		 548 aa  97.1  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  25.29 
 
 		 503 aa  96.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  22.18 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  23.7 
 
 		 518 aa  96.3  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  27.62 
 
 		 503 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  25.9 
 
 		 504 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  21.81 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  28.9 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  25.97 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  26.81 
 
 		 513 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  23.93 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  23.51 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  25.16 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  25 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  25 
 
 		 495 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  28.23 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  27.25 
 
 		 504 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  25.96 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  28.77 
 
 		 507 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  21.22 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 555 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  27.68 
 
 		 494 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  20.98 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  25.56 
 
 		 509 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  24.55 
 
 		 552 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 556 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  23.7 
 
 		 518 aa  90.1  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>