More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1595 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  534  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  68.7 
 
 		 241 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  68.26 
 
 		 239 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  67.81 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  68.26 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  67.81 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  68.7 
 
 		 239 aa  315  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  65.67 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  66.09 
 
 		 238 aa  311  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  67.24 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  63.52 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  66.81 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  65.65 
 
 		 238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  63.56 
 
 		 240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  62.2 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  67.39 
 
 		 239 aa  291  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  62.67 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  64.65 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 238 aa  271  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  58.15 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  54.11 
 
 		 232 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  50.69 
 
 		 244 aa  211  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  53.92 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  50.93 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  52.36 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  52.36 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  52.31 
 
 		 233 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  50 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  51.17 
 
 		 233 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  51.93 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  49.57 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  48.42 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  30.19 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  29.82 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.97 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  30.19 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  27.8 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  28.69 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.69 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  27.8 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  31.82 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  31.1 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  27.5 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.84 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.79 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.84 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.79 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>