244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0231 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  100 
 
 		 334 aa  691    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  42.77 
 
 		 533 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  33.22 
 
 		 516 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  32.39 
 
 		 502 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  28.17 
 
 		 551 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  31.42 
 
 		 551 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.97 
 
 		 248 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  27.95 
 
 		 548 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.9 
 
 		 307 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  32.14 
 
 		 544 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  24.92 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  24.75 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.39 
 
 		 541 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  32.41 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.59 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  27.38 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  34.88 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  34.11 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  34.11 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  29.22 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  27.54 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  26.07 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  27.54 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  23.91 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  26.24 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  32.03 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  27.43 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  26.79 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  27.43 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  32.82 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  29.09 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  34.09 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  31.48 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  23.49 
 
 		 517 aa  59.7  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  31.13 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  26.8 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  24.61 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  27.56 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  30.77 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  26.8 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  28.37 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  25.75 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  26.8 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  26.47 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  32.58 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  27.78 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  29.46 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  29.46 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  25.91 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  27.08 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  32.82 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  23.56 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  32.06 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  26.72 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  24.04 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.24 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  26.15 
 
 		 514 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  28.19 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  24.37 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.03 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  29.63 
 
 		 538 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  27.71 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  24.04 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  23.35 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  28.68 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  25.51 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  24.04 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  29.23 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  29.63 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  27.43 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  29.36 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  29.36 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  29.36 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  27.97 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  27.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  28.68 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.43 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  28.68 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  30.61 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  26.19 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.3 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  27.66 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  26.4 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  27.43 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 475 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  25.41 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  32.71 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  27.27 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  25.75 
 
 		 251 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  30.34 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  30.34 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  27.03 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  29.46 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  27.59 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  24.85 
 
 		 247 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  28.77 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  24.83 
 
 		 278 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>