More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0477 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  100 
 
 		 340 aa  700    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  53.33 
 
 		 358 aa  384  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  53.91 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  57.74 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  57.42 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  57.42 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  57.42 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  57.42 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  52.17 
 
 		 374 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  56.45 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  51.88 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  56.13 
 
 		 359 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  55.81 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  55.81 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  53.33 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  55.81 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  55.81 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  55.81 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  53.33 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  55.81 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  53.33 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  55.81 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  55.81 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  52.17 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  45.4 
 
 		 363 aa  305  9.000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  44.52 
 
 		 375 aa  272  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  44.41 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  43.41 
 
 		 376 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  43.23 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  39.64 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  43.2 
 
 		 296 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  40.97 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  39.35 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  36.95 
 
 		 349 aa  185  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  38.01 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  46.54 
 
 		 212 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  46.54 
 
 		 212 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  46.54 
 
 		 220 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 429 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  41.8 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  30.07 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  35.74 
 
 		 519 aa  135  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  32.64 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  43.56 
 
 		 215 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  29.61 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  37.2 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  37.2 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  37.2 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.8 
 
 		 203 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  37.2 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.2 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.2 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.2 
 
 		 241 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  37.2 
 
 		 203 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  37.28 
 
 		 203 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  41.04 
 
 		 272 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  34.34 
 
 		 661 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 647 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.06 
 
 		 661 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.36 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  34.36 
 
 		 649 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  26.7 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  32.52 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  28.07 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 616 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  27.91 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  29.83 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  29.56 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  36.63 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  32.46 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32.1 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  32.87 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  34.45 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 677 aa  62.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  27.49 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  35.07 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 		 698 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34.39 
 
 		 201 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  31.34 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  35.83 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  29.85 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 166 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  32.46 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  29.85 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  29.85 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  33.07 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>