119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4261 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  37.64 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 393 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  30.06 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  34.66 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  34.66 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  29.94 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  34.26 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  31.14 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  33.6 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  30 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.84 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  28.96 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  22.79 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  29.13 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  27.88 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.43 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.21 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  26.94 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.61 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.71 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  22.78 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.9 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  26.89 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.69 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 426 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 426 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 447 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  23 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 420 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 433 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  21.82 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  24.57 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  24.57 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  24.57 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  22.73 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.03 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  21.76 
 
 		 409 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.71 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  22.71 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>