182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1444 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  42.93 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  40.8 
 
 		 422 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  37.47 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  37.6 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  34.58 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  30.27 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  30.14 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.84 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  32.35 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  32.35 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.13 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  28.61 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  32.2 
 
 		 439 aa  156  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  32.14 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.7 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  33.42 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  34.14 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 		 441 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  30.63 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  30.75 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  32.14 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  32.54 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  30.96 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  30.91 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  30.19 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  27.66 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  29.26 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  31.65 
 
 		 437 aa  143  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  32.01 
 
 		 411 aa  143  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  32.53 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  29.15 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  29.05 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  28.86 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  31.58 
 
 		 446 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  28.91 
 
 		 441 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  31.58 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  30.19 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  31.58 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.94 
 
 		 440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  31.96 
 
 		 453 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.17 
 
 		 435 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  31.17 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  29.88 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  28.82 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  28.82 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  28.82 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  28.82 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  32.37 
 
 		 443 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  29.6 
 
 		 445 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.75 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  30 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  30 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  29.56 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  30.48 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  28.47 
 
 		 480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  29.53 
 
 		 449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  29 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.93 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  28.54 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 		 427 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  28.54 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  28.97 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  29.62 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  30.79 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  33.33 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  28.54 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  28.54 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  28.54 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  28.54 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  28.54 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  31.66 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  32.25 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  29.3 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  31.31 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  27.53 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  31.15 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  29.86 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  32.83 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  29.44 
 
 		 433 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  31.42 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.83 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  30.87 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.49 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  29.72 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  29.72 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  29.24 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  25.06 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  28.3 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  31.27 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  32.91 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  27.7 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  29.71 
 
 		 419 aa  103  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.26 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.88 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  27.58 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.01 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  30.62 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>