More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4983 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  73.72 
 
 		 291 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  61.2 
 
 		 301 aa  364  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  55.03 
 
 		 299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  56.95 
 
 		 308 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  55.59 
 
 		 308 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  54.49 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  52.4 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  44.4 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  42.91 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  41.69 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  44.4 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  48.79 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  40.4 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  40.34 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  41.5 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  45.85 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  49.77 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  41.22 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  43.28 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  41.22 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  43.62 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  40.38 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  37.04 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  41.37 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  39.77 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  39.45 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  39.66 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  36.71 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  37.17 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  37.59 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  39.02 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  36.66 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  45.98 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  47.91 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  41.8 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  41.5 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.62 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  47.22 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  44.93 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  42.69 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  37.76 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  45.58 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  37.76 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  42.07 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  37.76 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  42.41 
 
 		 310 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  36.43 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  48.36 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  40.23 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  37.76 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  44.81 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  40.15 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  46.98 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  39.25 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  47.03 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  39.52 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  39.52 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  41.02 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  34.46 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  39.77 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  36.73 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  39.33 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  36.91 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  39.73 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  46.19 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  37.58 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  41.6 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  45.04 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  40.3 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  37.35 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  36.39 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  37.54 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  37.54 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  39.69 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 311 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  37.04 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  43.14 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  36.24 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>