More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0662 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0662  chorismate synthase  100 
 
 		 380 aa  783    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  46.87 
 
 		 362 aa  338  9e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  40.05 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  39.51 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  40.56 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  38.65 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  37.16 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  38.74 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  36.76 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  35.62 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  38.15 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  35.62 
 
 		 364 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  36.12 
 
 		 377 aa  232  9e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  35.34 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  37.23 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  37.03 
 
 		 366 aa  229  8e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  38.21 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  38.8 
 
 		 363 aa  222  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  39.35 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  37.5 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  35.58 
 
 		 364 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  36.07 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  35.52 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  38.24 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  38.15 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  36.44 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  37.13 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  35.2 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  37 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  33.88 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  36.48 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  32.97 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  33.33 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  36.56 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  34.96 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  37.23 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  34.52 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  34.52 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  33.88 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  37.33 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  35.29 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  36.39 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  36.29 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  36.39 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  34.02 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  35.41 
 
 		 361 aa  199  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  36.15 
 
 		 371 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  35.71 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  36.83 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  36.02 
 
 		 364 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  34.22 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  33.42 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  36.02 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  34.06 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  35.58 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  33.69 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  34.59 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  35.28 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  34.73 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  34.59 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  36.36 
 
 		 442 aa  196  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  35.92 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  35.66 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  34.96 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  33.94 
 
 		 361 aa  195  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  34.51 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  34.51 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  35.09 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  34.86 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  37.74 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  37.74 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  37.74 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  36.63 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  34.66 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  33.95 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  33.07 
 
 		 361 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  35.23 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  37.74 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  37.74 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  37.74 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  35.19 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  37.74 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  34.22 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  35.5 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  34.32 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  35.95 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  34.66 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  37.47 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  37.74 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  33.69 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  36.39 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  33.78 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  34.51 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  34.69 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0331  chorismate synthase  34.05 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.288386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  36.39 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  35.95 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  36.22 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  35.31 
 
 		 362 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  36.93 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>