More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4191 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  81.63 
 
 		 245 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  80.82 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  80.41 
 
 		 264 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  47.76 
 
 		 244 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  50.2 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  50.2 
 
 		 244 aa  234  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  50.2 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  46.34 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  45.53 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  44.53 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  45.12 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  44.03 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  46.06 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  43.8 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  48.96 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  47.54 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 		 261 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  47.18 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  39.84 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  41.39 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 		 270 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  43.39 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  43.39 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  43.39 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  42.91 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  42.98 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  40.5 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  40.33 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  40.33 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  40.5 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  41.06 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  44.76 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  39.09 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  40.24 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  44.68 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  40.74 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  44.68 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  43.85 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01204  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  42.32 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  41.06 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  42 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  42 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  40.24 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  40.96 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  41.3 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  43.09 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  40.5 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02243  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02203  hypothetical protein  41.46 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2469  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  42 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  40.66 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  41.15 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  41.56 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1896  tRNA pseudouridine synthase A  41.39 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  40 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>