More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2847 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  723    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  60.93 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  59.44 
 
 		 944 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  51.82 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  54.08 
 
 		 379 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  36.45 
 
 		 354 aa  182  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  35.03 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.74 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.06 
 
 		 432 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  35.2 
 
 		 572 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.17 
 
 		 429 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.84 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.14 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  27.65 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.38 
 
 		 298 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  26.28 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.47 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.62 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  28.95 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  29.95 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  27.18 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  24.7 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.69 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 721 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.14 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.88 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.17 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 		 646 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 		 642 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  26.45 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  25.91 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02818  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 		 679 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  29.41 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  30.91 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.48 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  25.46 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  30.3 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  29.37 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  34.15 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.09 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  25.45 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  30.3 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  28.21 
 
 		 445 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  27.24 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  27.24 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0198  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.9 
 
 		 2335 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.13 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  33.8 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  24.64 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.33 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  21.32 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  26.88 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  31.48 
 
 		 432 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  28.4 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  29.35 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.32 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.36 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  26.45 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  24.06 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.74 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  29.95 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  24.73 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.44 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  25.36 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  30.36 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  28.48 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.48 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  30.11 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.44 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  26.24 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  29.19 
 
 		 441 aa  62.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  27.72 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.78 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  24.64 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.44 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  23.17 
 
 		 439 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  24.36 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3021  hypothetical protein  20.74 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0380667  normal  0.511265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  28.03 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  30.61 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  27.44 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  33.33 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  25.72 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  25.72 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  20.19 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  24.24 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  26.92 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  24.64 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  23.64 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  23.64 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  24.91 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  23.83 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  25.61 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 734 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  29.07 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  28.12 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.84 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  37.5 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>