More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0237 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
397 aa  762    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  66.57 
 
 
380 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.99 
 
 
380 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  66.57 
 
 
379 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  31.11 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  33.58 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  36.78 
 
 
362 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.81 
 
 
374 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  32.08 
 
 
440 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.4 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  33.96 
 
 
391 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  31.82 
 
 
405 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.3 
 
 
425 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 
385 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 
386 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 
377 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  26.25 
 
 
400 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 
383 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.41 
 
 
376 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 
379 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 
376 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 
377 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1044  nodulation protein NolF  33.22 
 
 
395 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.991845  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.3 
 
 
416 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  35.95 
 
 
392 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  29.31 
 
 
421 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.29 
 
 
387 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 
379 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 
342 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  27.73 
 
 
414 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  28.88 
 
 
467 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  25 
 
 
378 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  26.26 
 
 
364 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
386 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2353  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 
442 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 
426 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 
402 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  25.61 
 
 
373 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 
388 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  30.81 
 
 
381 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 
387 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.33 
 
 
367 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  31.41 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  29.82 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 
340 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  28.52 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  25.07 
 
 
368 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  24 
 
 
357 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.92 
 
 
401 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  29.71 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  30.57 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  30.53 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.47 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  34.16 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  29.71 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  27.27 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 
354 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.76 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  32.62 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  28.48 
 
 
398 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  29.29 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.24 
 
 
369 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 
379 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  31.1 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  35.54 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  27.62 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  31.42 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.33 
 
 
407 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.2 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25.54 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  29.47 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 
391 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  24.01 
 
 
372 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  26.19 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.55 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.93 
 
 
375 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  29.69 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7282  HlyD family secretion protein  31.97 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548499  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.92 
 
 
349 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  33.5 
 
 
358 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  24.71 
 
 
367 aa  92.8  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 
419 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>