More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4719 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  100 
 
 		 564 aa  1142    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  38.88 
 
 		 568 aa  356  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  41.25 
 
 		 570 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  37.48 
 
 		 584 aa  316  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.4 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  37.88 
 
 		 586 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  35.93 
 
 		 562 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  37.88 
 
 		 560 aa  299  9e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  35.63 
 
 		 603 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  35.77 
 
 		 593 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.36 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  35.46 
 
 		 587 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 569 aa  280  4e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.94 
 
 		 549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  34.77 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  33.15 
 
 		 587 aa  270  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  31.26 
 
 		 573 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  34.82 
 
 		 595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 		 582 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  30.4 
 
 		 610 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  30.05 
 
 		 594 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30 
 
 		 614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 595 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  27.21 
 
 		 566 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 580 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 		 534 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.56 
 
 		 540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  29.69 
 
 		 540 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 540 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 		 557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.49 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 538 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 532 aa  143  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  25.87 
 
 		 568 aa  140  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.59 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 544 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 550 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.45 
 
 		 521 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.45 
 
 		 521 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.45 
 
 		 521 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 521 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.46 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.26 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 510 aa  130  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 588 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.09 
 
 		 516 aa  124  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 505 aa  124  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2938  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 530 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 543 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.18 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.05 
 
 		 565 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 528 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.31 
 
 		 542 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 531 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 534 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 506 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  32.14 
 
 		 502 aa  120  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 622 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 520 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  28.57 
 
 		 531 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 534 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 534 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.75 
 
 		 547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.92 
 
 		 528 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 535 aa  116  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.99 
 
 		 505 aa  117  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 518 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.96 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>