170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2346 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
410 aa  805    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
395 aa  773    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  57.25 
 
 
389 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.75 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.75 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30.47 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  28.61 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  27.53 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.22 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  28.69 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  28.41 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
408 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  26.49 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  26.49 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  26.49 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  28.41 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  27.65 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  25.2 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  29.55 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  27.45 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  26.63 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  23.65 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  24.94 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  22.35 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  25.81 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  26.63 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  26.57 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  25.69 
 
 
435 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  26.75 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  26.76 
 
 
449 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  28.61 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.75 
 
 
416 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  24.46 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  27.61 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  28.17 
 
 
423 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.21 
 
 
407 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  24.2 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  32.64 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.25 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.25 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  31.25 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3624  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
431 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  23.4 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0807  multidrug resistance transporter, Bcr family  27.7 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.35 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4177  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  25.49 
 
 
469 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.42 
 
 
495 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  29.77 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.61 
 
 
512 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  30.61 
 
 
512 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  30.61 
 
 
512 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  29.45 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  30.61 
 
 
512 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  30.61 
 
 
512 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0419  General substrate transporter  25.34 
 
 
653 aa  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  30.61 
 
 
512 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 
478 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  31.34 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  21 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  24.17 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  33.98 
 
 
512 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.68 
 
 
465 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  37.23 
 
 
484 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
517 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.46 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  31 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  21.02 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  26.58 
 
 
582 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  28.38 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  28.38 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  24.32 
 
 
486 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2586  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
468 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941296  hitchhiker  0.00272882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  28.38 
 
 
403 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  24.32 
 
 
465 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  27.27 
 
 
413 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.87 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  27.48 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  28.35 
 
 
461 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 
521 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  23.81 
 
 
470 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  29.73 
 
 
475 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>