More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0171 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 540 aa  1085    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  42.69 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  38.62 
 
 		 567 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  32.49 
 
 		 548 aa  290  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  32.01 
 
 		 548 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  34.04 
 
 		 569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 		 554 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 		 627 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  32.53 
 
 		 567 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  34.55 
 
 		 562 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  34.18 
 
 		 565 aa  276  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  32.06 
 
 		 557 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 531 aa  266  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 		 551 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  30.42 
 
 		 557 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 559 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  31.34 
 
 		 547 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 		 553 aa  256  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  32.04 
 
 		 576 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 597 aa  239  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 		 579 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  28.76 
 
 		 560 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  28.76 
 
 		 560 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.01 
 
 		 556 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.28 
 
 		 545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.03 
 
 		 551 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 557 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 557 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 559 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.38 
 
 		 609 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.51 
 
 		 563 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 560 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 560 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.2 
 
 		 563 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 568 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 636 aa  169  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  26.96 
 
 		 572 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 604 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 604 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 564 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 568 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 		 580 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.97 
 
 		 562 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.49 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 675 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 620 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 625 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 		 587 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 625 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 524 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 579 aa  104  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.23 
 
 		 529 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0130  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 542 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 510 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.86 
 
 		 542 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 611 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  25.4 
 
 		 577 aa  98.2  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 		 534 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  24.17 
 
 		 631 aa  97.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 552 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 629 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 565 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 		 583 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  25.54 
 
 		 514 aa  95.1  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 516 aa  94  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 625 aa  94  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 534 aa  94  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 659 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 		 537 aa  93.6  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 521 aa  93.2  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.39 
 
 		 521 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 630 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 607 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 511 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 531 aa  91.3  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 522 aa  90.9  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 544 aa  90.5  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 516 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.07 
 
 		 532 aa  90.5  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 722 aa  90.1  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 		 549 aa  90.1  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  27.71 
 
 		 541 aa  90.1  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  21.83 
 
 		 517 aa  90.1  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>