More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3321 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  92.94 
 
 
451 aa  714    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
453 aa  865    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  96.34 
 
 
453 aa  693    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3385  TPR repeat-containing protein  66.41 
 
 
427 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981404  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
878 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.76 
 
 
810 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
448 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 
632 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
597 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
3145 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
1737 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
685 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 
639 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
637 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 
2240 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.94 
 
 
1022 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
681 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
909 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
573 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.72 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.31 
 
 
725 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
808 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.67 
 
 
733 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
847 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
739 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.56 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
718 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
673 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 
1486 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
3172 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.04 
 
 
676 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
1069 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.12 
 
 
816 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
3301 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.23 
 
 
875 aa  66.6  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 
638 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
602 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
209 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
505 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.18 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.35 
 
 
340 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
688 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.18 
 
 
384 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
649 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.82 
 
 
594 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  33.91 
 
 
535 aa  63.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
762 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 
624 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 
565 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.3 
 
 
780 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
750 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.84 
 
 
795 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
750 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.86 
 
 
603 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.69 
 
 
764 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.88 
 
 
1676 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
828 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 
472 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 
612 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
362 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.8 
 
 
714 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.3 
 
 
681 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  28.4 
 
 
725 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 
1450 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
828 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.82 
 
 
622 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.49 
 
 
1154 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2492  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 
441 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 
1034 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
824 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 
557 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.18 
 
 
832 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
326 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  41.05 
 
 
649 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
542 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
632 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  41.05 
 
 
649 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
323 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.26 
 
 
732 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  29.75 
 
 
661 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
1005 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.28 
 
 
1764 aa  57.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
615 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
313 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
732 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
643 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  31.68 
 
 
603 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.73 
 
 
887 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.54 
 
 
358 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.37 
 
 
935 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.28 
 
 
1694 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
583 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 
553 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
766 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 
589 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.4 
 
 
820 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.06 
 
 
695 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
968 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>