More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4284 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
871 aa  1758    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.53 
 
 
817 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  40.25 
 
 
869 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.9 
 
 
805 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.43 
 
 
882 aa  535  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.42 
 
 
823 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.33 
 
 
813 aa  499  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.81 
 
 
807 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  37.61 
 
 
821 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.31 
 
 
915 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.28 
 
 
805 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.31 
 
 
822 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  37.7 
 
 
796 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.82 
 
 
809 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.99 
 
 
814 aa  458  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.69 
 
 
862 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  38.57 
 
 
805 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.59 
 
 
805 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  35.27 
 
 
802 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.84 
 
 
807 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.6 
 
 
816 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.73 
 
 
883 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  37.48 
 
 
808 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  37.33 
 
 
809 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  33 
 
 
797 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  37.36 
 
 
798 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.71 
 
 
878 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  35.67 
 
 
865 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  36.22 
 
 
804 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  35.2 
 
 
831 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.48 
 
 
893 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.34 
 
 
821 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  33.58 
 
 
804 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  36.09 
 
 
800 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  37.42 
 
 
806 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  36.5 
 
 
803 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  35.12 
 
 
819 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  37.03 
 
 
805 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.76 
 
 
879 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  32.89 
 
 
887 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.52 
 
 
808 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  36.83 
 
 
808 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  35.31 
 
 
811 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.15 
 
 
805 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  32.16 
 
 
845 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  35.98 
 
 
808 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.59 
 
 
919 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  34.72 
 
 
816 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.33 
 
 
809 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.56 
 
 
913 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.75 
 
 
849 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32.75 
 
 
887 aa  354  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.5 
 
 
874 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  32.41 
 
 
817 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  33.25 
 
 
810 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.42 
 
 
812 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.94 
 
 
817 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.21 
 
 
810 aa  343  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.94 
 
 
855 aa  340  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  32.88 
 
 
808 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.93 
 
 
844 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  32.06 
 
 
843 aa  336  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.2 
 
 
888 aa  331  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.87 
 
 
820 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.83 
 
 
880 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  35.3 
 
 
835 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.65 
 
 
846 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.22 
 
 
884 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.29 
 
 
803 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  33.05 
 
 
810 aa  307  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.37 
 
 
803 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  32.96 
 
 
819 aa  286  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.72 
 
 
848 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  30.12 
 
 
931 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  27.06 
 
 
809 aa  276  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 
810 aa  274  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 
813 aa  273  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.95 
 
 
807 aa  269  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.8 
 
 
844 aa  263  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  32.64 
 
 
861 aa  261  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  28.61 
 
 
810 aa  258  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.76 
 
 
828 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 
770 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 
795 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
798 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
797 aa  134  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 
795 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 
800 aa  130  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
793 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 
797 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.3 
 
 
811 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 
800 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 
816 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 
805 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
813 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 
807 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 
800 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 
784 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 
793 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 
791 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>