More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4057 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  100 
 
 
292 aa  604  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  34.96 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  32.6 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  32.05 
 
 
335 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  34.04 
 
 
333 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  33.62 
 
 
333 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  34.04 
 
 
333 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  34.04 
 
 
333 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  33.62 
 
 
333 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  33.19 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  33.05 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  33.05 
 
 
333 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  33.05 
 
 
333 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  32.48 
 
 
424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  33.48 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  29.96 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  28.79 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  27.14 
 
 
245 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  27.97 
 
 
345 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  29.92 
 
 
263 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  26.09 
 
 
385 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  29.43 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  29.64 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  31.49 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  40 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.22 
 
 
217 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  31.06 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.39 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  33.52 
 
 
242 aa  92.8  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.59 
 
 
265 aa  92.4  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  51.14 
 
 
391 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  29.05 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  30.6 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  31.1 
 
 
370 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  29.41 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  38.33 
 
 
192 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  29.64 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  28.94 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  38.33 
 
 
192 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  34.97 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
202 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  29.05 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  27.27 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  28.24 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  36.99 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.7 
 
 
580 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  29.8 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  40 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  26.56 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.39 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  31.95 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  38.26 
 
 
278 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  27.2 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  27.21 
 
 
391 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  38.58 
 
 
201 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  28 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  36.11 
 
 
476 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  41.23 
 
 
225 aa  86.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  29.02 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  39.32 
 
 
202 aa  85.1  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  45.05 
 
 
1048 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  40 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  25.53 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  37.39 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  38.84 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.75 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  26.64 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  35.2 
 
 
450 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  26.22 
 
 
308 aa  82  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  35.71 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  27.6 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  27.6 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  25 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.71 
 
 
205 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  28.75 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  36.3 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  36.52 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  33.91 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  32.85 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  30.86 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  30.96 
 
 
532 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  34.03 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  34.96 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  31.16 
 
 
532 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  29.3 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  27.5 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.34 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  29.49 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.88 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  35.9 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  32.35 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  34.43 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
194 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>