222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0630 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  936    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  26.52 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  24.74 
 
 
380 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  27.66 
 
 
276 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  26.01 
 
 
299 aa  97.4  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  28.45 
 
 
380 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  27.94 
 
 
267 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  22.47 
 
 
293 aa  77  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  24.8 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  24 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  20.34 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  25.19 
 
 
326 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  30.17 
 
 
432 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  32.18 
 
 
331 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  32.18 
 
 
331 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  28.24 
 
 
430 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  32.18 
 
 
330 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  32.06 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  29.46 
 
 
320 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  41.94 
 
 
320 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
487 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  28.26 
 
 
455 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  28.24 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  35.23 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  44.83 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  42.62 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  30.71 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  31.94 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  28.78 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.06 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  24.84 
 
 
440 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  40 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  32.2 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  22.8 
 
 
407 aa  53.9  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  31.9 
 
 
458 aa  53.9  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  37.23 
 
 
314 aa  53.5  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  32.98 
 
 
309 aa  53.5  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  25.87 
 
 
430 aa  53.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  37.7 
 
 
296 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  39.34 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  23.36 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  35.96 
 
 
291 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  23.65 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  22.46 
 
 
349 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  29.08 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.36 
 
 
290 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  27.53 
 
 
457 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  39.34 
 
 
294 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  31.82 
 
 
322 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  28.69 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  27.45 
 
 
308 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  44.07 
 
 
309 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  24.24 
 
 
433 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  29.57 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  39.34 
 
 
296 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  41.51 
 
 
363 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  25.36 
 
 
449 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  25.36 
 
 
449 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  41.51 
 
 
309 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  25.36 
 
 
449 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  24.84 
 
 
454 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  40.98 
 
 
320 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  30.51 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  34.74 
 
 
316 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  27.34 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  27.18 
 
 
333 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  21.96 
 
 
385 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  28.3 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  29.38 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  30.68 
 
 
311 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  26.57 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  30.68 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  37.7 
 
 
297 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 
430 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  27.97 
 
 
308 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  36.67 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  40.62 
 
 
303 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  41.51 
 
 
328 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  39.34 
 
 
329 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  26.45 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  32.56 
 
 
351 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  40.62 
 
 
303 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 
451 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  41.94 
 
 
335 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  26.92 
 
 
429 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3811  hypothetical protein  26.98 
 
 
380 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  31.72 
 
 
411 aa  50.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  35 
 
 
317 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  35 
 
 
317 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  35 
 
 
317 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  35 
 
 
317 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  28.57 
 
 
430 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.36 
 
 
447 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  35 
 
 
287 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  33.87 
 
 
304 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  29.89 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  24.89 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  37.93 
 
 
310 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  35.85 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>