190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2563 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
412 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  75.32 
 
 
413 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  36.66 
 
 
397 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  34.72 
 
 
410 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  34.72 
 
 
410 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.59 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  34.72 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  34.26 
 
 
414 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
432 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  30.33 
 
 
415 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  33.04 
 
 
435 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  30.37 
 
 
408 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  30 
 
 
389 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.75 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  33.33 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  30.84 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  31.75 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  30.37 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  30.37 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  30.37 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  30.59 
 
 
530 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  33.51 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  29.5 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  28.92 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2282  major facilitator transporter  35.07 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302645  hitchhiker  0.000646359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3291  major facilitator transporter  28.36 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  29.88 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
414 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  27.53 
 
 
401 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  28.82 
 
 
398 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  29.82 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  30.49 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  30 
 
 
410 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  32.62 
 
 
423 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 
378 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  26.44 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3049  major facilitator transporter  27.75 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  28.82 
 
 
272 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  38.18 
 
 
423 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  27.98 
 
 
406 aa  53.5  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.32 
 
 
395 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  31.37 
 
 
408 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  27.47 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  41.24 
 
 
473 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  28.57 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
529 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  32 
 
 
471 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  31.2 
 
 
466 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
453 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  26.92 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  32.08 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2705  multidrug efflux system protein MdtE  29.19 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.23 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  27.86 
 
 
531 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  30.4 
 
 
466 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  34 
 
 
494 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  31.97 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  27.1 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
513 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  26.21 
 
 
468 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 
549 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 
549 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.97 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1329  multidrug efflux system protein MdtE  30.65 
 
 
465 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3100  multidrug efflux system protein MdtE  30.65 
 
 
465 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000024134  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1212  multidrug efflux system protein MdtE  30.65 
 
 
465 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.5282e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  27.27 
 
 
526 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.09 
 
 
538 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  36.19 
 
 
492 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 
478 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
505 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 
478 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 
531 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 
549 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 
494 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 
508 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.36 
 
 
531 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 
474 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.36 
 
 
531 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  29.36 
 
 
528 aa  46.6  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.36 
 
 
549 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  27.36 
 
 
531 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.08 
 
 
528 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  25.97 
 
 
477 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>