More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0195 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1276 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.96 
 
 
1694 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
543 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.27 
 
 
397 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 
878 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
927 aa  99.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
4079 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
804 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 
596 aa  96.7  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
562 aa  96.3  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
467 aa  95.5  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.12 
 
 
810 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
512 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.64 
 
 
632 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
466 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
465 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.8 
 
 
635 aa  93.2  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 
784 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 
465 aa  92.8  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.25 
 
 
1979 aa  92.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
435 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.8 
 
 
465 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.62 
 
 
560 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
3560 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
465 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
452 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
466 aa  85.5  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
4489 aa  85.5  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.75 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.12 
 
 
576 aa  85.1  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.9 
 
 
707 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.81 
 
 
1007 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
602 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.85 
 
 
730 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
634 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.54 
 
 
573 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.29 
 
 
1138 aa  82  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
711 aa  82.4  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 
836 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
1094 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
699 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 
564 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
3035 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
1121 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
402 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
3145 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
662 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  31.21 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.33 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.88 
 
 
863 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  28.8 
 
 
398 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
329 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 
743 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.56 
 
 
745 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
750 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.9 
 
 
561 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  32.64 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
761 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
1192 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
687 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 
833 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
1069 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.12 
 
 
1067 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
1049 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.9 
 
 
561 aa  73.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
1297 aa  72.8  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.54 
 
 
820 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.22 
 
 
577 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30.22 
 
 
577 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
467 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.93 
 
 
661 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
1276 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
617 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06745  TPR repeat protein  30.56 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  31.34 
 
 
643 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
714 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>