More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3977 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 291 aa  590  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  73.72 
 
 		 293 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  59.73 
 
 		 301 aa  353  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  56.04 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  54.42 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  55.44 
 
 		 308 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  53.49 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  49.83 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  41.98 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  44.57 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  40.54 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  44.14 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.95 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  40.68 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  40.27 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  41.78 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  45.91 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  42.91 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40.7 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  41.91 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  40.88 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  42.31 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  40.96 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  41.24 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.46 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  46.15 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  49.54 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  38.78 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  39.45 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  42.52 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  40.14 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  45.31 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  35.25 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  49.06 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  41.02 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  39.8 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  39.8 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  42.11 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  38.28 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  38.28 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  38.06 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  38.67 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  37.95 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  41.16 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  41.38 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  40.56 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  44.75 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  35.69 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  40.86 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  46.98 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  40.61 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  45.12 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 302 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  40.21 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40.55 
 
 		 305 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  38.87 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  39.16 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  39.16 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  36.98 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  50.24 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  43.54 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  41.8 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  38.81 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  38.51 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  39.86 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  37.02 
 
 		 283 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  48.84 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  38.51 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  45.87 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  38.81 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>