192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1572 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  55.85 
 
 		 2207 aa  2421    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  44.43 
 
 		 1945 aa  782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  43.61 
 
 		 2002 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  55.81 
 
 		 1803 aa  1995    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  50.83 
 
 		 1754 aa  1147    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  55.65 
 
 		 2222 aa  2373    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  44 
 
 		 1983 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  46.77 
 
 		 1980 aa  792    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  43.99 
 
 		 1986 aa  716    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  46.36 
 
 		 1973 aa  828    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  46.26 
 
 		 1950 aa  828    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  56.6 
 
 		 2197 aa  2448    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  46.09 
 
 		 1958 aa  948    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  45.96 
 
 		 1991 aa  689    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  56.49 
 
 		 2204 aa  2370    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  45.23 
 
 		 1958 aa  820    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  36.91 
 
 		 1959 aa  699    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  100 
 
 		 2198 aa  4470    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  58.32 
 
 		 2016 aa  2210    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  40.89 
 
 		 2013 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  38.97 
 
 		 1888 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1939  DNA helicase-related protein  55.92 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  38.19 
 
 		 1622 aa  440  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  33.55 
 
 		 1559 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  35.09 
 
 		 1877 aa  432  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  34.47 
 
 		 1854 aa  432  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  35.17 
 
 		 1575 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  36.79 
 
 		 1593 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  42.45 
 
 		 2759 aa  423  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  43.8 
 
 		 1328 aa  423  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1722 aa  413  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  38.31 
 
 		 1861 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  35.62 
 
 		 1867 aa  414  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  34.52 
 
 		 1571 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  33.99 
 
 		 1853 aa  404  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  33.97 
 
 		 1572 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  40.17 
 
 		 1904 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  33.88 
 
 		 1589 aa  399  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1589 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1589 aa  397  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  37.9 
 
 		 2096 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1823 aa  376  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  33.33 
 
 		 1559 aa  377  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  41.56 
 
 		 2045 aa  370  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  34.28 
 
 		 2125 aa  363  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  34.28 
 
 		 2125 aa  363  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  40.24 
 
 		 2123 aa  358  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  32.75 
 
 		 2005 aa  344  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  41.24 
 
 		 1801 aa  323  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.65 
 
 		 1403 aa  317  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  38.18 
 
 		 1838 aa  286  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  37.3 
 
 		 1822 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  32.79 
 
 		 1822 aa  246  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  36.18 
 
 		 1363 aa  225  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  34.89 
 
 		 1296 aa  213  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  30.19 
 
 		 1328 aa  211  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  30.43 
 
 		 2098 aa  200  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  30.48 
 
 		 2098 aa  199  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 2104 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 2101 aa  181  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 2101 aa  181  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 		 2098 aa  179  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  28.96 
 
 		 1367 aa  175  9e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.54 
 
 		 1312 aa  171  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1413 aa  155  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1506 aa  144  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  30.1 
 
 		 1285 aa  144  1.9999999999999998e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1392 aa  143  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  29.27 
 
 		 1489 aa  132  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  27.52 
 
 		 1629 aa  131  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  27.47 
 
 		 1622 aa  123  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1407 aa  122  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1400 aa  121  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.18 
 
 		 1490 aa  120  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  25.19 
 
 		 1412 aa  119  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  28.73 
 
 		 1697 aa  118  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  27.49 
 
 		 1649 aa  114  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1652 aa  112  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  22.53 
 
 		 1050 aa  112  8.000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  28.57 
 
 		 1630 aa  112  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1474 aa  109  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  24.78 
 
 		 1790 aa  107  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1499 aa  106  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3340  hypothetical protein  60.47 
 
 		 237 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1670 aa  103  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27.6 
 
 		 1575 aa  101  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  25.55 
 
 		 1410 aa  101  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1254 aa  99  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  34.15 
 
 		 194 aa  97.8  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1724 aa  96.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  25.22 
 
 		 1387 aa  94  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.95 
 
 		 1523 aa  92.8  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  25.79 
 
 		 1694 aa  89.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.46 
 
 		 946 aa  89.4  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25.89 
 
 		 1121 aa  89.4  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  26.39 
 
 		 928 aa  87.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  28.67 
 
 		 906 aa  86.7  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  28.66 
 
 		 905 aa  83.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  29.64 
 
 		 900 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  28.66 
 
 		 905 aa  82.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>