224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0064 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  100 
 
 
418 aa  848  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  62.59 
 
 
425 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  62.35 
 
 
425 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  60.75 
 
 
428 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  62.26 
 
 
424 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  61.79 
 
 
424 aa  493  1e-138  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  55.81 
 
 
439 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  55.35 
 
 
439 aa  468  1e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  55.58 
 
 
439 aa  468  1e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  1.84372e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  55.35 
 
 
439 aa  468  1e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  51.63 
 
 
417 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34040  OprD family outer membrane porin  45.71 
 
 
431 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  45.22 
 
 
425 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  7.49415e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  42.02 
 
 
422 aa  312  6e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  42.23 
 
 
427 aa  302  7e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  43.53 
 
 
421 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  41.31 
 
 
441 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  43.29 
 
 
421 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  41.31 
 
 
443 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  41.77 
 
 
414 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  38.29 
 
 
446 aa  273  4e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  1.58939e-06  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  38.22 
 
 
448 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  37.47 
 
 
448 aa  244  2e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  37.78 
 
 
447 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  35.33 
 
 
441 aa  234  2e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  36.99 
 
 
445 aa  233  4e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  35.98 
 
 
446 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  35.33 
 
 
441 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  36.47 
 
 
445 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  35.66 
 
 
416 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  34.29 
 
 
440 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  34.89 
 
 
418 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  35.71 
 
 
441 aa  221  2e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  34.66 
 
 
418 aa  221  2e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  35.46 
 
 
455 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  34.66 
 
 
418 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  35.31 
 
 
447 aa  219  9e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  35.31 
 
 
447 aa  219  9e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.82651e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  35.31 
 
 
447 aa  219  9e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  35.31 
 
 
447 aa  219  9e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  35.23 
 
 
448 aa  216  6e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  32.8 
 
 
433 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  3.30448e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  32.67 
 
 
441 aa  215  1e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  34.64 
 
 
419 aa  214  2e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  33.87 
 
 
421 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  34.03 
 
 
468 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  33.79 
 
 
418 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  33.73 
 
 
395 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  33.64 
 
 
421 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  35.47 
 
 
447 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  33.72 
 
 
417 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  35.62 
 
 
447 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  31.66 
 
 
433 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  35.39 
 
 
447 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  33.94 
 
 
422 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32.29 
 
 
423 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  33.26 
 
 
422 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  31.44 
 
 
433 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  33.41 
 
 
427 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  31.78 
 
 
405 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  31.76 
 
 
429 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  33.98 
 
 
418 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  35.1 
 
 
431 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  34.13 
 
 
426 aa  202  1e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  32.86 
 
 
412 aa  201  2e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  33.17 
 
 
433 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  32.68 
 
 
427 aa  200  4e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  32.54 
 
 
412 aa  199  8e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  33.63 
 
 
449 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  33.41 
 
 
479 aa  198  1e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  34.3 
 
 
428 aa  197  2e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  32.54 
 
 
412 aa  196  4e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  31.02 
 
 
421 aa  196  5e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  32.3 
 
 
412 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  31.46 
 
 
416 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  32.5 
 
 
417 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  31.63 
 
 
410 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  32.85 
 
 
424 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  31.92 
 
 
421 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  32.08 
 
 
420 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  31.76 
 
 
417 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  33.91 
 
 
411 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  33.33 
 
 
413 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  32.13 
 
 
410 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  32.56 
 
 
422 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  31.71 
 
 
422 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  32.37 
 
 
410 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  34.3 
 
 
420 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  32.88 
 
 
444 aa  189  6e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  32.35 
 
 
416 aa  189  6e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  8.11517e-08 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  30.32 
 
 
422 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  32.43 
 
 
444 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  32.66 
 
 
444 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  33.26 
 
 
444 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  31.16 
 
 
423 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  31.29 
 
 
417 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  30.54 
 
 
429 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  31.78 
 
 
409 aa  185  1e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  31.21 
 
 
424 aa  185  1e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  30.41 
 
 
429 aa  186  1e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>