221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17140 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  100 
 
 		 405 aa  822    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  63.14 
 
 		 420 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  63.55 
 
 		 422 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  63.82 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  62.5 
 
 		 423 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  60.76 
 
 		 428 aa  514  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  59.36 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  58.99 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  59.61 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  60.05 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  58.13 
 
 		 410 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  57.68 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  57.86 
 
 		 416 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  57.43 
 
 		 422 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  57.4 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  56.02 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  57.32 
 
 		 421 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  56.62 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  56.37 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  55.88 
 
 		 418 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  58.42 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  55.94 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  56.19 
 
 		 412 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  55.8 
 
 		 412 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  55.94 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  56.48 
 
 		 419 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  54.3 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  53.17 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  51.93 
 
 		 422 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  49.11 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  47.16 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  48.27 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  45.72 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  47.77 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  46.3 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  48.88 
 
 		 416 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  48.14 
 
 		 416 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  44.64 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  43.41 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  44.31 
 
 		 431 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  44.89 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  43.89 
 
 		 430 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  42.17 
 
 		 427 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  42.33 
 
 		 427 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  43.32 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  43.07 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  42.75 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  43.07 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  42.51 
 
 		 416 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  42.51 
 
 		 416 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  42.93 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  41.56 
 
 		 421 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  42.17 
 
 		 418 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  42.08 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  41.92 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  41.91 
 
 		 421 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  40.43 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  41.94 
 
 		 416 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  40.82 
 
 		 411 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  41.16 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  40.35 
 
 		 410 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.05 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  39.6 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  40.1 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  39.6 
 
 		 410 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  42.21 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  42.13 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  42.39 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  40.53 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  36.6 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  39.81 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  39.6 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  40.84 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  36.84 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  37.14 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  36.6 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.74 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  37.83 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.34 
 
 		 420 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  38.81 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  37.44 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  37.53 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  34.44 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  36.34 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  37.19 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  36.05 
 
 		 439 aa  255  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  36.95 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  36.24 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  37.56 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  35.44 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  36.39 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  36.83 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  37.53 
 
 		 417 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  37.96 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  36.87 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  35.99 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  36.71 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  37.07 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  37.29 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  35.75 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>