220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00920 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  89.15 
 
 
422 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  92.86 
 
 
424 aa  750    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  100 
 
 
423 aa  860    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  73.67 
 
 
428 aa  614  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  70.13 
 
 
426 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  65.79 
 
 
418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  68.37 
 
 
418 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  69.97 
 
 
429 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  64.94 
 
 
417 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  66.75 
 
 
418 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  66.17 
 
 
418 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  65.73 
 
 
395 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  66.34 
 
 
412 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  62.96 
 
 
422 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  64.2 
 
 
422 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  66.5 
 
 
418 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  66.58 
 
 
412 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  62.5 
 
 
405 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  64.83 
 
 
412 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  63.79 
 
 
415 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  64.11 
 
 
412 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  65.44 
 
 
419 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  63.29 
 
 
416 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  62.12 
 
 
421 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  62.32 
 
 
410 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  59.37 
 
 
416 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  57.14 
 
 
420 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  58.37 
 
 
424 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  54.82 
 
 
422 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  49.76 
 
 
413 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  52.57 
 
 
417 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  51.34 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  48.43 
 
 
417 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  48.17 
 
 
417 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  46.34 
 
 
423 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  49.38 
 
 
416 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  48.88 
 
 
416 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  47.03 
 
 
431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  46.38 
 
 
430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  45.89 
 
 
430 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  45.14 
 
 
430 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  44.05 
 
 
418 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  43.54 
 
 
418 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  44.31 
 
 
416 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  41.84 
 
 
421 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  41.23 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  43.09 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  43.81 
 
 
416 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  43.81 
 
 
416 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  43.58 
 
 
427 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  43.58 
 
 
427 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  43.1 
 
 
415 aa  316  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  43.5 
 
 
421 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  41.52 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  42.92 
 
 
422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  41.52 
 
 
410 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  41.01 
 
 
410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  41.01 
 
 
417 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  43.36 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  43 
 
 
429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  42.75 
 
 
429 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  42.33 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  39.62 
 
 
428 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  40.94 
 
 
421 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.29 
 
 
412 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  39.86 
 
 
416 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  41.65 
 
 
409 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  41.89 
 
 
409 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  38.59 
 
 
411 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  38.53 
 
 
439 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  40.15 
 
 
416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  38.3 
 
 
440 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  38.69 
 
 
433 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  38.32 
 
 
433 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  38.3 
 
 
416 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  36.91 
 
 
440 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.07 
 
 
420 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  37.56 
 
 
457 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.34 
 
 
420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  39.14 
 
 
431 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  37.53 
 
 
440 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  38.12 
 
 
441 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  37.79 
 
 
439 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  37.76 
 
 
429 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  37.53 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  38.63 
 
 
433 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  38.11 
 
 
431 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  38.16 
 
 
417 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  37.92 
 
 
417 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  37.32 
 
 
443 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  36.56 
 
 
430 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  37.65 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  38.35 
 
 
424 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  36.79 
 
 
439 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  35.98 
 
 
445 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  34.73 
 
 
463 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  36.56 
 
 
418 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  36.99 
 
 
437 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  35.75 
 
 
426 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  37.2 
 
 
417 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>