More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1764 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  100 
 
 		 465 aa  924    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0135  ribonuclease  46.37 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1269  ribonuclease  43.3 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1186  ribonuclease  42.22 
 
 		 454 aa  362  6e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1450  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.96 
 
 		 471 aa  300  4e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.107409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  36.2 
 
 		 564 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  36.84 
 
 		 687 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  35.33 
 
 		 559 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  35.29 
 
 		 645 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  37.34 
 
 		 653 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  37.34 
 
 		 653 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  37.56 
 
 		 713 aa  264  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  35.2 
 
 		 494 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  36.16 
 
 		 562 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  35.94 
 
 		 1093 aa  259  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  35.57 
 
 		 1022 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  36.13 
 
 		 682 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  36.59 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  33.06 
 
 		 525 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  37.31 
 
 		 669 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  38.85 
 
 		 487 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  36.78 
 
 		 485 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  36.19 
 
 		 1093 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  35.71 
 
 		 1040 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  35.52 
 
 		 515 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  38.32 
 
 		 624 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  35.6 
 
 		 808 aa  249  8e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  36.34 
 
 		 1123 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  34.44 
 
 		 974 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  35.66 
 
 		 990 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  34.53 
 
 		 922 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  34.85 
 
 		 647 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  36.54 
 
 		 489 aa  246  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  33.41 
 
 		 483 aa  246  8e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  35.02 
 
 		 1194 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  35.04 
 
 		 1073 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  36.15 
 
 		 646 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  32.56 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  35.51 
 
 		 1120 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  34.54 
 
 		 702 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  34.38 
 
 		 1427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  34.46 
 
 		 1061 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000196842  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2042  ribonuclease E  34.46 
 
 		 1057 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000184616  hitchhiker  0.00765925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01080  fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA-binding protein/RNA degradosome binding protein  34.46 
 
 		 1061 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00444981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  34.46 
 
 		 1061 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  35.04 
 
 		 1057 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1207  ribonuclease E  34.46 
 
 		 1061 aa  243  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1061 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1463  ribonuclease E  34.46 
 
 		 1061 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00215249  hitchhiker  0.000000103406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2241  ribonuclease E  34.46 
 
 		 1061 aa  243  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000115068  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  34.46 
 
 		 1061 aa  243  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  32.55 
 
 		 492 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  35.27 
 
 		 1128 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  37.2 
 
 		 908 aa  243  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  34.22 
 
 		 1067 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  36.03 
 
 		 1007 aa  242  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1282  ribonuclease E  34.22 
 
 		 1068 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783205  hitchhiker  0.0000048225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  34.22 
 
 		 1067 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  34.22 
 
 		 1068 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  34.39 
 
 		 646 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  34.22 
 
 		 1067 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  35.98 
 
 		 489 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  38.55 
 
 		 488 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  32.03 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  32.03 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  34.62 
 
 		 1041 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  36.63 
 
 		 640 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  34.94 
 
 		 1012 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  36.99 
 
 		 571 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  35.61 
 
 		 991 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  35.28 
 
 		 411 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  35.61 
 
 		 991 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  35.61 
 
 		 987 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1600  ribonuclease E  34.22 
 
 		 1048 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  35.02 
 
 		 1082 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  34.27 
 
 		 495 aa  240  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2816  ribonuclease E  34.7 
 
 		 1121 aa  240  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00267025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  35.82 
 
 		 1238 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  36.63 
 
 		 640 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  36.93 
 
 		 1132 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  33.5 
 
 		 457 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  35.27 
 
 		 1139 aa  239  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  36.56 
 
 		 1132 aa  239  9e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  35.38 
 
 		 961 aa  239  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  34.98 
 
 		 490 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  34.98 
 
 		 944 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  34.31 
 
 		 1091 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  34.31 
 
 		 1090 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  35.77 
 
 		 953 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  34.31 
 
 		 1072 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  32.59 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  35.11 
 
 		 605 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  32.59 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  34.55 
 
 		 1175 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  34.31 
 
 		 1086 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  33.25 
 
 		 1065 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2511  ribonuclease E  34.46 
 
 		 1113 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00474333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  37.5 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  34.46 
 
 		 1122 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1615  ribonuclease, Rne/Rng family  34.7 
 
 		 1058 aa  237  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000319313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>