185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1784 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  100 
 
 		 1118 aa  2328    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1172 aa  684    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  53.97 
 
 		 1116 aa  1156    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  53.16 
 
 		 1126 aa  1147    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  39.63 
 
 		 1082 aa  708    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  35.31 
 
 		 1153 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1121 aa  559  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  34.8 
 
 		 1198 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  35.13 
 
 		 1163 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1139 aa  511  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  33.13 
 
 		 1151 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  35.1 
 
 		 1143 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  34.72 
 
 		 1143 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  34.72 
 
 		 1143 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  32.77 
 
 		 1250 aa  486  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1215 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1215 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  30.87 
 
 		 1228 aa  446  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  32.15 
 
 		 1196 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1247 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1175 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  36.15 
 
 		 1280 aa  291  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  31.47 
 
 		 1270 aa  239  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1350 aa  230  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  34.29 
 
 		 522 aa  229  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.05 
 
 		 1324 aa  228  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  30.68 
 
 		 487 aa  178  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  30.02 
 
 		 494 aa  168  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  30.38 
 
 		 512 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  29.31 
 
 		 480 aa  163  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  27.98 
 
 		 486 aa  160  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  29.11 
 
 		 493 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  29.11 
 
 		 493 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  26.81 
 
 		 512 aa  151  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.84 
 
 		 934 aa  129  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.56 
 
 		 902 aa  121  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1259 aa  116  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  27.96 
 
 		 1271 aa  113  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.57 
 
 		 902 aa  111  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.95 
 
 		 986 aa  110  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1275 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  24.53 
 
 		 495 aa  104  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  24.26 
 
 		 1255 aa  103  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.99 
 
 		 606 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  25.54 
 
 		 502 aa  101  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.21 
 
 		 752 aa  100  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.5 
 
 		 1038 aa  98.2  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  26.14 
 
 		 396 aa  98.2  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.64 
 
 		 1048 aa  94.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  23.74 
 
 		 446 aa  94  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  21.93 
 
 		 490 aa  93.2  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  27.51 
 
 		 535 aa  93.2  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.27 
 
 		 797 aa  93.6  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  27.21 
 
 		 635 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  27.49 
 
 		 390 aa  91.7  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  28.43 
 
 		 491 aa  91.3  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  27.59 
 
 		 686 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.16 
 
 		 901 aa  91.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.23 
 
 		 486 aa  89.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.76 
 
 		 1408 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.18 
 
 		 629 aa  86.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  25.56 
 
 		 1097 aa  85.9  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  22.5 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  27.07 
 
 		 632 aa  85.9  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.42 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  23.47 
 
 		 483 aa  84.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  29.81 
 
 		 636 aa  82  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  29.89 
 
 		 609 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25.09 
 
 		 650 aa  80.1  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  23.64 
 
 		 1457 aa  80.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.09 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  22.06 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  20.57 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  31.64 
 
 		 619 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.09 
 
 		 611 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.66 
 
 		 1077 aa  75.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  21.64 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  47.13 
 
 		 193 aa  76.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.36 
 
 		 622 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1018 aa  75.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  24.83 
 
 		 1427 aa  75.5  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.66 
 
 		 1090 aa  75.1  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  27.55 
 
 		 622 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30 
 
 		 651 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  30 
 
 		 237 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.98 
 
 		 521 aa  73.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  28.57 
 
 		 716 aa  73.2  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.91 
 
 		 925 aa  72.4  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  25.85 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  25.85 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.72 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  26.36 
 
 		 1585 aa  71.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  26.36 
 
 		 1585 aa  71.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.91 
 
 		 643 aa  70.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  20.97 
 
 		 1428 aa  69.3  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.98 
 
 		 795 aa  69.3  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  27.34 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  26.54 
 
 		 633 aa  68.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.5 
 
 		 655 aa  68.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>