More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2121 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  100 
 
 		 433 aa  906    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  49.75 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  52.28 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  51.8 
 
 		 391 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  49.75 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  47.02 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  47.81 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  47.03 
 
 		 401 aa  359  6e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  46.8 
 
 		 386 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 407 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  46.61 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  44.22 
 
 		 407 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  43.11 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  43 
 
 		 392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  34.82 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  34.65 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03390  hypothetical protein  47.9 
 
 		 169 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000152663  unclonable  2.59325e-22 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  29.33 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  28.49 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  28.23 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  27.95 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  27.95 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  28.75 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.36 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.25 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  26.97 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  27.55 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  27.59 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  25.84 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  25.9 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  25.96 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  27.15 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  27.94 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.07 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.45 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  27.03 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.96 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  25.73 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  25.38 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  25.38 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  25.38 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  30.6 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  29.58 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.6 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.6 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.53 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.13 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.87 
 
 		 297 aa  97.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  29.01 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  28.87 
 
 		 297 aa  97.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  36.16 
 
 		 190 aa  97.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  24.46 
 
 		 381 aa  96.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  30.77 
 
 		 276 aa  95.9  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  28.63 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.92 
 
 		 260 aa  96.3  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  32.6 
 
 		 293 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  25.2 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  26.62 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  30.77 
 
 		 292 aa  94.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.29 
 
 		 381 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.09 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.09 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  24.69 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 376 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.42 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  25.95 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.93 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  30.38 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.53 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  27.27 
 
 		 273 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  30.71 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23 
 
 		 363 aa  90.1  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.13 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.04 
 
 		 376 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.23 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.63 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  26.1 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  33.5 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.15 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.57 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.2 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  27.97 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  26.41 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  27.06 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.67 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.67 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.22 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  23.62 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.91 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.23 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  22.71 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  23.85 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  25.48 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.27 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  22.04 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.68 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>