260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1564 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 697 aa  1444    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  36.38 
 
 		 695 aa  409  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 672 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 699 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 681 aa  273  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  30.17 
 
 		 710 aa  260  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  30.02 
 
 		 688 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  29.71 
 
 		 688 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  29.45 
 
 		 724 aa  250  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  29.07 
 
 		 688 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  29.98 
 
 		 686 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  28.92 
 
 		 688 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  27.76 
 
 		 687 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  28.22 
 
 		 719 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  27.91 
 
 		 723 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  29.81 
 
 		 745 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  29.9 
 
 		 687 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  29.81 
 
 		 749 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  29.81 
 
 		 749 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  29.8 
 
 		 753 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  29.52 
 
 		 745 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  29.52 
 
 		 745 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  29.52 
 
 		 745 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  29.75 
 
 		 709 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  29.28 
 
 		 713 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  28.34 
 
 		 726 aa  230  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  29.62 
 
 		 725 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  29.62 
 
 		 698 aa  226  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  27.09 
 
 		 691 aa  224  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  28.96 
 
 		 710 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  28.96 
 
 		 710 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  28.96 
 
 		 710 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  28.17 
 
 		 681 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  28.46 
 
 		 686 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  28.36 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 668 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  28.02 
 
 		 681 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  25.95 
 
 		 667 aa  217  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  27.29 
 
 		 676 aa  212  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  27.3 
 
 		 684 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  27.13 
 
 		 676 aa  209  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  27.41 
 
 		 669 aa  201  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  28.4 
 
 		 668 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  27.56 
 
 		 699 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  26.64 
 
 		 662 aa  197  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  27.96 
 
 		 663 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  28.64 
 
 		 661 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  27.7 
 
 		 667 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  28.25 
 
 		 668 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 702 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 760 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 673 aa  165  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.31 
 
 		 665 aa  164  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 702 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 702 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 768 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 696 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 661 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 698 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 705 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 685 aa  123  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  22.78 
 
 		 708 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 750 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 713 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 741 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 713 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 713 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 793 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.06 
 
 		 625 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 713 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 749 aa  110  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 708 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  22.37 
 
 		 701 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 729 aa  108  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 767 aa  108  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 716 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 713 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  22.5 
 
 		 772 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 721 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 766 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 713 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 685 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 714 aa  99  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 683 aa  99  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 717 aa  97.1  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  21.33 
 
 		 687 aa  95.1  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 780 aa  94  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 705 aa  89  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 766 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.66 
 
 		 775 aa  87  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 769 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 773 aa  85.1  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 684 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 758 aa  75.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  26.24 
 
 		 764 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 		 744 aa  74.7  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  21.79 
 
 		 857 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>