More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0045 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0045  type III secretion protein SctC  100 
 
 		 672 aa  1371    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  27.62 
 
 		 748 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  27.54 
 
 		 776 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  25.37 
 
 		 673 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  26.67 
 
 		 758 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  27.65 
 
 		 645 aa  184  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  26.27 
 
 		 634 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  26.56 
 
 		 658 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  27.42 
 
 		 658 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  25.36 
 
 		 670 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  25.74 
 
 		 655 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  24.03 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  25.79 
 
 		 682 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  23.63 
 
 		 641 aa  160  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.51 
 
 		 636 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  24.09 
 
 		 728 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  24.2 
 
 		 648 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  24.13 
 
 		 632 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  23.43 
 
 		 805 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  24.23 
 
 		 686 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  24.23 
 
 		 686 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  24.23 
 
 		 686 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  24.23 
 
 		 686 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  23.17 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  24.57 
 
 		 793 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  23.77 
 
 		 686 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  23.99 
 
 		 703 aa  143  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  24.7 
 
 		 783 aa  142  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  22.82 
 
 		 807 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  24.76 
 
 		 650 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  22.29 
 
 		 681 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  22.09 
 
 		 689 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  23.97 
 
 		 675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  24.18 
 
 		 649 aa  135  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  23.43 
 
 		 803 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  24.53 
 
 		 672 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  22.62 
 
 		 704 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  23.97 
 
 		 674 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  24.46 
 
 		 747 aa  133  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  22.78 
 
 		 706 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  24.27 
 
 		 658 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.08 
 
 		 750 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  25.98 
 
 		 725 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  23.48 
 
 		 650 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  21.85 
 
 		 705 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  22.29 
 
 		 705 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  21.97 
 
 		 705 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  22.21 
 
 		 702 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  30.57 
 
 		 810 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  23.21 
 
 		 710 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  22.36 
 
 		 704 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  23.31 
 
 		 753 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  22.19 
 
 		 703 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  22.24 
 
 		 700 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  22.24 
 
 		 700 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  20.39 
 
 		 892 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  21.33 
 
 		 697 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  31.05 
 
 		 829 aa  122  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  23.03 
 
 		 703 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  21.63 
 
 		 904 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  21.53 
 
 		 902 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 650 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  22.17 
 
 		 724 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  20.92 
 
 		 897 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  29.74 
 
 		 720 aa  120  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 654 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  24.27 
 
 		 819 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  22.73 
 
 		 710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 654 aa  119  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  21.51 
 
 		 660 aa  119  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  22.97 
 
 		 707 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 736 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  22.41 
 
 		 714 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  23.04 
 
 		 738 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  22.28 
 
 		 702 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  27.11 
 
 		 784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  22.7 
 
 		 640 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  22.7 
 
 		 640 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  23.16 
 
 		 662 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  28.7 
 
 		 740 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  22.7 
 
 		 640 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  25.73 
 
 		 789 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  24.86 
 
 		 718 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  29.01 
 
 		 781 aa  107  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 781 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  27.65 
 
 		 779 aa  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  30.65 
 
 		 803 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 635 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  30.37 
 
 		 803 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 805 aa  103  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  28.7 
 
 		 774 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  22.8 
 
 		 660 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  28.48 
 
 		 787 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  21.86 
 
 		 686 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  29.45 
 
 		 793 aa  101  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  27.22 
 
 		 794 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  26.51 
 
 		 377 aa  97.8  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  25.99 
 
 		 714 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  27.15 
 
 		 797 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  26.63 
 
 		 630 aa  97.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>