More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0021 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0021  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  100 
 
 		 497 aa  1026    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.17 
 
 		 576 aa  140  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2548  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.99 
 
 		 650 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.975526 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2933  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.99 
 
 		 646 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.05 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1358  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.33 
 
 		 588 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.51 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.41 
 
 		 526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14781  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  25.54 
 
 		 573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.922098  normal  0.231202 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0646  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.16 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.547153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  26.68 
 
 		 688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2150  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.05 
 
 		 604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00157683  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  27.19 
 
 		 574 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1400  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.68 
 
 		 581 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09631  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  27.33 
 
 		 576 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1409  exodeoxyribonuclease V  26.02 
 
 		 530 aa  103  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0787348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  28.36 
 
 		 742 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1056  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.84 
 
 		 609 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.923429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  24.29 
 
 		 659 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  27.74 
 
 		 738 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.61 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  26.52 
 
 		 754 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  26.6 
 
 		 742 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  25.67 
 
 		 720 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1211  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.92 
 
 		 787 aa  97.1  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  24.75 
 
 		 739 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  25.06 
 
 		 744 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  25.62 
 
 		 741 aa  95.1  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  25.42 
 
 		 725 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  26.81 
 
 		 744 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0998  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.84 
 
 		 586 aa  92.8  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.25 
 
 		 732 aa  93.2  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  27.52 
 
 		 742 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25 
 
 		 598 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  26.03 
 
 		 750 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  24.73 
 
 		 750 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.22 
 
 		 728 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  25.73 
 
 		 736 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  25.11 
 
 		 731 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  25.27 
 
 		 731 aa  90.1  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  25.36 
 
 		 727 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  24.69 
 
 		 733 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  25.8 
 
 		 740 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  26.15 
 
 		 738 aa  88.6  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.77 
 
 		 744 aa  87.8  4e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  24.94 
 
 		 740 aa  87.8  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2169  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.56 
 
 		 601 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  25.48 
 
 		 726 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  25.88 
 
 		 768 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  24.7 
 
 		 733 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  27.14 
 
 		 743 aa  87  7e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  24.94 
 
 		 746 aa  87  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  26.73 
 
 		 728 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10640  exonuclease V alpha subunit recD  25.81 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.47997e-19  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  25.5 
 
 		 728 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  28.18 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  23.47 
 
 		 738 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  24.76 
 
 		 762 aa  83.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  23.72 
 
 		 727 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  25.68 
 
 		 698 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.18 
 
 		 698 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  24.44 
 
 		 736 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  24.71 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  27.61 
 
 		 728 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0343  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.03 
 
 		 599 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0371  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.33 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  24.03 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.65 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.64 
 
 		 551 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  24.49 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  24.94 
 
 		 747 aa  81.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  25.79 
 
 		 740 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  24.88 
 
 		 733 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  24.17 
 
 		 711 aa  80.5  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  24.14 
 
 		 736 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  24.7 
 
 		 607 aa  80.1  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  23.88 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  23.44 
 
 		 641 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  24.61 
 
 		 637 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  21.7 
 
 		 555 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  26.89 
 
 		 726 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  24.3 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  25.17 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  23.68 
 
 		 731 aa  78.2  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.77 
 
 		 746 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  25.66 
 
 		 731 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1847  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.43 
 
 		 683 aa  78.2  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.401727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2745  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.26 
 
 		 641 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  23.96 
 
 		 744 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  23.96 
 
 		 744 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  25.19 
 
 		 740 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0872  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.05 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.938405  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  23.57 
 
 		 810 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3139  exonuclease V subunit alpha  32.05 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3043  exonuclease V subunit alpha  32.05 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.225396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0896  exonuclease V subunit alpha  32.05 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.07 
 
 		 795 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  26.54 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02667  exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain  32.05 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02628  hypothetical protein  32.05 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>