134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1400 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 
373 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  43.32 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 
368 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  34.32 
 
 
770 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  35.67 
 
 
392 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  38.35 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  29.02 
 
 
347 aa  189  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  37.21 
 
 
333 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  28.74 
 
 
347 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  32.92 
 
 
457 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  33.44 
 
 
487 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 
837 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.43 
 
 
490 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  32.97 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  31.8 
 
 
423 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  33.05 
 
 
373 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  31.09 
 
 
778 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  37.13 
 
 
399 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 
678 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  35.83 
 
 
491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.77 
 
 
474 aa  169  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  31.35 
 
 
477 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  34.75 
 
 
388 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  31.03 
 
 
357 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  27.91 
 
 
495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  32.49 
 
 
488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.67 
 
 
497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1844  glycoside hydrolase family protein  36.2 
 
 
386 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000515386  hitchhiker  0.000606941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  31.13 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  30.09 
 
 
357 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.43 
 
 
454 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  27.44 
 
 
820 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 
628 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  34.8 
 
 
398 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  32.94 
 
 
1037 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  32.91 
 
 
451 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  31.46 
 
 
486 aa  159  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  34.63 
 
 
383 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  32.92 
 
 
338 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  27.45 
 
 
474 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  28.21 
 
 
451 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  35.07 
 
 
394 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  29.85 
 
 
503 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  28.44 
 
 
815 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  29.43 
 
 
829 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  29.55 
 
 
689 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  28.05 
 
 
472 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  28.39 
 
 
756 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
382 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  29.71 
 
 
457 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  30.05 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  29.43 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  31.21 
 
 
309 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  31.21 
 
 
370 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  31.38 
 
 
543 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  32.46 
 
 
375 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  29.58 
 
 
331 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  28.46 
 
 
389 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  34.07 
 
 
376 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  27 
 
 
369 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  28.14 
 
 
1001 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  31.82 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  29.1 
 
 
1041 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  27.2 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.97 
 
 
697 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  28.11 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  27.64 
 
 
370 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 
463 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  28.87 
 
 
328 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  28.73 
 
 
364 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  30.53 
 
 
1478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  31.33 
 
 
382 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  28.27 
 
 
1059 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  28.27 
 
 
1059 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  29.3 
 
 
566 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.400635 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  26.79 
 
 
357 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  28.53 
 
 
465 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  26.71 
 
 
321 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  28.08 
 
 
407 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.57 
 
 
1019 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  30.8 
 
 
1020 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 
619 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  27.66 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  30.38 
 
 
561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  30.37 
 
 
1018 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  27.7 
 
 
1050 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  28.02 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  29.88 
 
 
912 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  24.83 
 
 
321 aa  109  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  29.75 
 
 
690 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  28.42 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  25.68 
 
 
756 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  26.57 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  24.19 
 
 
674 aa  89.7  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  27.04 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  22.73 
 
 
1495 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 
1077 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  23.55 
 
 
806 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  24.83 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>