More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0118 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  100 
 
 		 417 aa  825    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  32.22 
 
 		 441 aa  223  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  29.96 
 
 		 523 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  31.76 
 
 		 522 aa  199  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  33.75 
 
 		 347 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  32.24 
 
 		 391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  26.24 
 
 		 589 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  27.7 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  28.12 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  35.06 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  30.35 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  38.14 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  41.34 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  37.5 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  37.21 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  41.57 
 
 		 576 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  41.57 
 
 		 576 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  27.23 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  25.65 
 
 		 317 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.38 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.38 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.94 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  23.84 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.06 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  22.65 
 
 		 491 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23 
 
 		 468 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.17 
 
 		 451 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.21 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.72 
 
 		 481 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  24.16 
 
 		 479 aa  94  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.96 
 
 		 447 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  26.93 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.53 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  24.88 
 
 		 434 aa  90.1  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  25.56 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  25.2 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  24.15 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.12 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.23 
 
 		 466 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  24.26 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.73 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  24.62 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  23.32 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.84 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.84 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.54 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  22.91 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  23.71 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  24.2 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  24.2 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  24.2 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  24.2 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  24.2 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  24.54 
 
 		 538 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  24.2 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.27 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.99 
 
 		 471 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  23.7 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  23.71 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.22 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.56 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.69 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  23.6 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.12 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  26.87 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  21.49 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.06 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.63 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  23.88 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  23.88 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  23.88 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  23.88 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.56 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  23.88 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  22.28 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5019  hypothetical protein  27.53 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.67 
 
 		 491 aa  79.7  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  23.37 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  21.69 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  22.86 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.3 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.58 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.78 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  22.22 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  24.09 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  22.22 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.28 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  26.6 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  23.59 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  26.18 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.91 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.06 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.45 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  21.56 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  24.13 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  23.1 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.35 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>