More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0314 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  100 
 
 		 147 aa  289  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  71.63 
 
 		 138 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  56.38 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  52.11 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  49.32 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4059  hypothetical protein  56.86 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000946335  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  44.97 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3861  methylation site containing protein  45.58 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000627365 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  35.51 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  41.38 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  71.43 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  38.36 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  66.67 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  43.4 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  71.43 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  42.53 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.24 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  79.49 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  52.11 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  88.24 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  83.78 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0370  prepilin-type cleavage/methylation  39.85 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000439379  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  63.27 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  63.27 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  73.68 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  78.38 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  96.67 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  85.29 
 
 		 196 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  73.81 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  50 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  85.29 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  85.29 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  31.65 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  60.87 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  65.91 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  93.33 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  68.29 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  85.29 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  50 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  71.05 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  93.33 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  52.94 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  87.5 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  85.29 
 
 		 174 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  82.35 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  71.05 
 
 		 171 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  48.44 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  33.91 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  79.41 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  45.45 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  65.91 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  57.45 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  47.17 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  55.32 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  55.32 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  66.67 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  72.22 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  51.06 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  30.95 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  74.29 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  40.3 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45.9 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  51.72 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  65.79 
 
 		 182 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  71.05 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  50.85 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  33.86 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  73.68 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  40.22 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.85 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  60.53 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  60.53 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  58.14 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  60.53 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  75 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  41.49 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  53.33 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  54.76 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  50 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0426  methylation site containing protein  53.09 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000282584  hitchhiker  0.000848946 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  57.14 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  55.81 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  52.27 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  61.54 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  40.66 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  64.71 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  64.71 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  63.16 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  80 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  47.83 
 
 		 207 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  42.67 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.92 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  36.84 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  65.62 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  60 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  60 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  58.97 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  75 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  79.55 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>