More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1327 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  81.46 
 
 		 391 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  81.68 
 
 		 391 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 384 aa  776    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  81.07 
 
 		 376 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  81.07 
 
 		 376 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  81.07 
 
 		 376 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  81.07 
 
 		 376 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  81.07 
 
 		 376 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  80.32 
 
 		 379 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  79.52 
 
 		 377 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  81.68 
 
 		 391 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  81.41 
 
 		 391 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  80.11 
 
 		 377 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  80.11 
 
 		 377 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  80.11 
 
 		 377 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  80.11 
 
 		 377 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  80.11 
 
 		 377 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  80.11 
 
 		 377 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  80.11 
 
 		 377 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  79.84 
 
 		 377 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  80.11 
 
 		 377 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  79.52 
 
 		 381 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  47.03 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  47.44 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  47.55 
 
 		 375 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  47.83 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  48.1 
 
 		 376 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  45.74 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  46.34 
 
 		 371 aa  342  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  46.34 
 
 		 371 aa  342  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  46.43 
 
 		 389 aa  338  8e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  47.44 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  47.44 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  45.66 
 
 		 389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  47.04 
 
 		 389 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  46.79 
 
 		 374 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  47.3 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  44.99 
 
 		 385 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  46.34 
 
 		 375 aa  326  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  48.39 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  42.35 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  42.97 
 
 		 1106 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  39.62 
 
 		 357 aa  295  7e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 1171 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  40.67 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  40.16 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 378 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 		 368 aa  269  7e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  42.97 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  39.02 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  40.41 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  39.84 
 
 		 380 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  38.48 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  40.11 
 
 		 405 aa  255  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  38.42 
 
 		 378 aa  252  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  38.16 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  39.84 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  39.77 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  38.52 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  36.18 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  36.46 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  34.89 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  32.61 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  33.24 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  34.3 
 
 		 376 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  31.32 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  34.13 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  35.38 
 
 		 376 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30.75 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  35.31 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  31.97 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  32.56 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  34.67 
 
 		 936 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  34.67 
 
 		 936 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 390 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  33.24 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  31.87 
 
 		 914 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  33.33 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.98 
 
 		 907 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 364 aa  175  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>