More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4696 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 384 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  82.53 
 
 		 375 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  81.72 
 
 		 375 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  78.92 
 
 		 378 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  73.12 
 
 		 376 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  53.39 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  53.39 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  50 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  54.83 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  56.79 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  57.34 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  47.92 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  47.97 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  51.09 
 
 		 379 aa  361  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  46.74 
 
 		 377 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  47.84 
 
 		 376 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  57.18 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  47.57 
 
 		 376 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  47.57 
 
 		 376 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  47.57 
 
 		 376 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  47.57 
 
 		 376 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  47.15 
 
 		 377 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  46.88 
 
 		 377 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  46.88 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  46.88 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  46.88 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  46.88 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  46.88 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  46.88 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  46.88 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  47.63 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  48.17 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  48.92 
 
 		 379 aa  352  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  47.71 
 
 		 384 aa  346  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  48.99 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  45.82 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  46.59 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  46.59 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  47.97 
 
 		 381 aa  332  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 387 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  46.34 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  45.23 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  43.72 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  43.47 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  43.24 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  42.02 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  45.04 
 
 		 1106 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  44.35 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  43.05 
 
 		 369 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  41.71 
 
 		 378 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 1171 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  41.35 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  43.31 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  43.02 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  38.86 
 
 		 375 aa  265  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  38.86 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  40 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  41.22 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  40.05 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 		 378 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  37.01 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  35.51 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  39.1 
 
 		 427 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  37.43 
 
 		 376 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  37.04 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  35.17 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  34.04 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 		 377 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  37.43 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  38.11 
 
 		 381 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  34.74 
 
 		 376 aa  195  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  32.15 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  36.87 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  31.58 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.51 
 
 		 907 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.25 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  31.23 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  33.62 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  32.66 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 380 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  35.41 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>