More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2298 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  48.66 
 
 		 879 aa  769    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 874 aa  1764    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 		 941 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  37.81 
 
 		 941 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  37.81 
 
 		 941 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 		 903 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 935 aa  485  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 906 aa  476  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 906 aa  476  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 906 aa  476  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 914 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 913 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 927 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 893 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  31.98 
 
 		 827 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 928 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 875 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 869 aa  376  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 852 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 948 aa  364  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 849 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 861 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 861 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 861 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 855 aa  343  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 871 aa  342  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 847 aa  340  7e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 944 aa  339  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 861 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 861 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 861 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 857 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  31.86 
 
 		 880 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  30.7 
 
 		 834 aa  312  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 866 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 890 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 890 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 872 aa  302  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 909 aa  301  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 890 aa  299  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  28.86 
 
 		 866 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 950 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 867 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 867 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.91 
 
 		 877 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 867 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 901 aa  289  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 867 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 904 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1001 aa  283  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 991 aa  282  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 869 aa  279  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 884 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 930 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 909 aa  272  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 930 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 930 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 910 aa  267  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 876 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 956 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 935 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 935 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 935 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.66 
 
 		 839 aa  266  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 935 aa  265  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 854 aa  265  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 924 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 924 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 924 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 965 aa  264  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 896 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 869 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 883 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.56 
 
 		 884 aa  261  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 800 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 883 aa  260  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 883 aa  260  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 891 aa  259  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 843 aa  259  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 953 aa  259  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 841 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1006 aa  254  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 897 aa  253  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 981 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 873 aa  250  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.93 
 
 		 853 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  26.74 
 
 		 936 aa  249  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1055 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 838 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 853 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 873 aa  248  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 836 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 853 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 853 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 853 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 842 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 868 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 933 aa  243  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 894 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 987 aa  243  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>