More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0817 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  62.62 
 
 		 593 aa  782    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 599 aa  1240    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  49.54 
 
 		 604 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  43.11 
 
 		 1017 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  44.65 
 
 		 622 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  44.82 
 
 		 1005 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  45.05 
 
 		 609 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  46.55 
 
 		 614 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  44.01 
 
 		 600 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  44.89 
 
 		 1942 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  47.02 
 
 		 1891 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.99 
 
 		 1855 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  43.33 
 
 		 925 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.51 
 
 		 1975 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.63 
 
 		 2068 aa  395  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  37.57 
 
 		 723 aa  353  5e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  30.52 
 
 		 620 aa  209  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  32.85 
 
 		 838 aa  198  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  29.19 
 
 		 885 aa  197  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  28.29 
 
 		 610 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.82 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.73 
 
 		 2638 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  30.88 
 
 		 752 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  27.3 
 
 		 624 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 		 617 aa  164  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.28 
 
 		 1021 aa  162  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 836 aa  161  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  28.3 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.83 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  27.37 
 
 		 617 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  27.83 
 
 		 649 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 650 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  29.05 
 
 		 814 aa  157  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  26.73 
 
 		 528 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  27.35 
 
 		 659 aa  157  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  28.38 
 
 		 623 aa  157  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  27.75 
 
 		 564 aa  157  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  27.53 
 
 		 462 aa  156  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.53 
 
 		 528 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  26.77 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  27.55 
 
 		 655 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 477 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.29 
 
 		 642 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  27.66 
 
 		 526 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  27.34 
 
 		 609 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.92 
 
 		 589 aa  152  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.67 
 
 		 574 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  25.95 
 
 		 571 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.63 
 
 		 587 aa  150  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 653 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  28.24 
 
 		 683 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  25.55 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  27.78 
 
 		 574 aa  145  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  25.54 
 
 		 486 aa  144  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 630 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  26.97 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  27.67 
 
 		 639 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  29.54 
 
 		 586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  26.86 
 
 		 878 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  26.71 
 
 		 686 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  26.46 
 
 		 644 aa  137  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  29.51 
 
 		 532 aa  137  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 765 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.89 
 
 		 484 aa  136  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 		 589 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  24.96 
 
 		 576 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  27.76 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  27.51 
 
 		 654 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  24.41 
 
 		 665 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.09 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.3 
 
 		 584 aa  134  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  25.6 
 
 		 690 aa  133  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  25.09 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  26.2 
 
 		 687 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.05 
 
 		 559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 786 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  25.97 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  25.41 
 
 		 778 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  24.95 
 
 		 774 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  27.2 
 
 		 646 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  26.96 
 
 		 665 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26 
 
 		 586 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26 
 
 		 586 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26 
 
 		 586 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 878 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  27.73 
 
 		 586 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  26.6 
 
 		 619 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.89 
 
 		 552 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 703 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  26.51 
 
 		 583 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  26.26 
 
 		 623 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.54 
 
 		 586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  27.41 
 
 		 676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.43 
 
 		 610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>