More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3061 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  100 
 
 
767 aa  1540    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  69.59 
 
 
334 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  75.94 
 
 
338 aa  301  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  67.28 
 
 
428 aa  300  9e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  65 
 
 
333 aa  296  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  67.91 
 
 
380 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  68.78 
 
 
233 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  72.11 
 
 
494 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  57.47 
 
 
338 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  70.62 
 
 
343 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  56.62 
 
 
1001 aa  280  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  61.82 
 
 
411 aa  270  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  69.59 
 
 
692 aa  269  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  59.62 
 
 
221 aa  260  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  59.55 
 
 
225 aa  260  8e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  57.77 
 
 
524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  49.21 
 
 
357 aa  222  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  55.67 
 
 
356 aa  213  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  56.06 
 
 
1160 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  46.41 
 
 
683 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  60.22 
 
 
212 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  59.12 
 
 
212 aa  196  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  46.61 
 
 
298 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  51.53 
 
 
336 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  44.93 
 
 
337 aa  181  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1687  polysaccharide deacetylase  51.15 
 
 
336 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000644335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  36.44 
 
 
221 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 
227 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 
292 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 
267 aa  104  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 
273 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 
465 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  34.22 
 
 
291 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
320 aa  100  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.64 
 
 
468 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 
317 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.78 
 
 
417 aa  98.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  30.69 
 
 
237 aa  97.8  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 
503 aa  96.3  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
542 aa  96.3  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
283 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.96 
 
 
279 aa  94.7  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
263 aa  94  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  30.06 
 
 
307 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 
229 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 
240 aa  92  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
247 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  30.05 
 
 
287 aa  91.3  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.46 
 
 
251 aa  90.5  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
199 aa  90.1  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  33.71 
 
 
364 aa  89.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  29.23 
 
 
373 aa  89.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.6 
 
 
440 aa  89  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 
238 aa  89  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
465 aa  89  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 
352 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
272 aa  88.6  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
242 aa  88.2  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 
522 aa  87.8  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  34.68 
 
 
488 aa  87.4  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 
522 aa  87.8  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 
255 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 
372 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 
264 aa  86.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 
537 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
275 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  29.67 
 
 
249 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
275 aa  84  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  34.64 
 
 
259 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
259 aa  84  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  25.11 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 
1124 aa  82.4  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
275 aa  82  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.94 
 
 
275 aa  82  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  34.09 
 
 
258 aa  82  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.94 
 
 
275 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
275 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
275 aa  82  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
260 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  32.57 
 
 
373 aa  82  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
275 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
275 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.63 
 
 
1099 aa  81.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  30.46 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  30.94 
 
 
275 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
273 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>