59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_0044 on replicon NC_010657
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  43.58 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  41.72 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0096  pilx9 protein  40.39 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164234  normal  0.522922 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  34.1 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  32.9 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  31.86 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  33 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  33 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  34.98 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  26.62 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.56 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.26 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  28.97 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  28.19 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.12 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.73 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.73 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  26.86 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.95 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.77 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  26.73 
 
 		 259 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.93 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  25.91 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.92 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  24.56 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.76 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.37 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  24.26 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.24 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.01 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.86 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.75 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.46 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.1 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  27.27 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.17 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.11 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  27.84 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.75 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.45 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  25.95 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  24.56 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.67 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.3 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.1 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  25.5 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.6 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  24.9 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  23.71 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  22.61 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  21.72 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  22.85 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  21.43 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.53 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.74 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  21.48 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.21 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>