More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0847 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1632    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32.61 
 
 		 843 aa  334  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  33.07 
 
 		 842 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 		 852 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.65 
 
 		 848 aa  293  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  32.2 
 
 		 845 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  31.56 
 
 		 847 aa  266  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  27.89 
 
 		 854 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  30.33 
 
 		 834 aa  253  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  29.41 
 
 		 849 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  30.55 
 
 		 856 aa  236  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 838 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 		 859 aa  233  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 		 853 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  29.66 
 
 		 836 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  28.68 
 
 		 851 aa  227  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  28.52 
 
 		 849 aa  219  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  30.33 
 
 		 825 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.79 
 
 		 841 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  27.18 
 
 		 873 aa  210  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 		 839 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.66 
 
 		 850 aa  201  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.11 
 
 		 821 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  28.59 
 
 		 861 aa  191  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 855 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 		 806 aa  187  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  29.33 
 
 		 853 aa  185  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.12 
 
 		 870 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.37 
 
 		 849 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.42 
 
 		 857 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.11 
 
 		 856 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 		 861 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.91 
 
 		 858 aa  167  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 		 855 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.2 
 
 		 866 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 		 853 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.97 
 
 		 855 aa  158  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  29.09 
 
 		 828 aa  158  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.56 
 
 		 835 aa  158  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.51 
 
 		 858 aa  157  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 873 aa  155  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25 
 
 		 850 aa  153  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 847 aa  153  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  28.16 
 
 		 843 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 		 866 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 857 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  29.53 
 
 		 841 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 871 aa  141  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 847 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.43 
 
 		 846 aa  138  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 857 aa  137  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  25.87 
 
 		 858 aa  137  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 839 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 930 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 		 878 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.66 
 
 		 863 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 		 837 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.45 
 
 		 854 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  28.07 
 
 		 846 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  25.74 
 
 		 857 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.12 
 
 		 829 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.12 
 
 		 829 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 846 aa  112  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 884 aa  111  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 		 845 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.28 
 
 		 852 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  25.52 
 
 		 868 aa  105  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 855 aa  105  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 849 aa  104  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 404 aa  104  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4731  protein of unknown function DUF214  31.14 
 
 		 842 aa  104  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.31 
 
 		 844 aa  104  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 		 855 aa  104  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  30.1 
 
 		 408 aa  103  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  27.7 
 
 		 843 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.64 
 
 		 855 aa  102  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.18 
 
 		 859 aa  102  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 849 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.32 
 
 		 443 aa  101  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.84 
 
 		 417 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.58 
 
 		 420 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.5 
 
 		 397 aa  100  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 		 406 aa  99  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  32.27 
 
 		 842 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.25 
 
 		 386 aa  98.6  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  38.26 
 
 		 452 aa  97.8  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  24.75 
 
 		 397 aa  97.8  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.45 
 
 		 880 aa  97.8  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  32.8 
 
 		 842 aa  97.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  22.4 
 
 		 896 aa  97.4  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.94 
 
 		 411 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.75 
 
 		 386 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  27.34 
 
 		 657 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 		 842 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  28.88 
 
 		 386 aa  95.1  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  27.01 
 
 		 897 aa  95.1  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 		 857 aa  94.7  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  27.96 
 
 		 657 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.36 
 
 		 390 aa  94.4  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 386 aa  94.4  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>