More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2959 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 380 aa  749    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  72.77 
 
 		 379 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  75.6 
 
 		 383 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  76 
 
 		 386 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  72.77 
 
 		 379 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  72.85 
 
 		 384 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  72.8 
 
 		 388 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.95 
 
 		 385 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  63.31 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  63.06 
 
 		 398 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  62.96 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  61.32 
 
 		 403 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  60.67 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  60.88 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  60.2 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.26 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  60.26 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  60 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.26 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  59.22 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  59.48 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  59.07 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  59.48 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  59.48 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  59.48 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  59.48 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  58.03 
 
 		 403 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  56.81 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  56.81 
 
 		 383 aa  411  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  58.87 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  58.73 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  58.6 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  58.6 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.35 
 
 		 390 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  55.47 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.25 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  57.74 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.82 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  50.53 
 
 		 386 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  50.27 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  50.27 
 
 		 386 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  51.99 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  50.82 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50.99 
 
 		 385 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.13 
 
 		 385 aa  342  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.5 
 
 		 408 aa  340  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  50.68 
 
 		 386 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  50.41 
 
 		 386 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  52.66 
 
 		 389 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  51 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.27 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.33 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  48.58 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.98 
 
 		 391 aa  309  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.49 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  47.97 
 
 		 513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  50.94 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  45.67 
 
 		 443 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  49.85 
 
 		 465 aa  298  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  45.31 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.22 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  47.23 
 
 		 451 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  48.55 
 
 		 350 aa  278  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  52.41 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  49.34 
 
 		 457 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  45.33 
 
 		 474 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  45.33 
 
 		 474 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  45.48 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  44.32 
 
 		 450 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  44.32 
 
 		 450 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  44.32 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  46.65 
 
 		 496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  47.56 
 
 		 468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  46.3 
 
 		 472 aa  273  3e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  45.45 
 
 		 472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  44.76 
 
 		 450 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  44.04 
 
 		 450 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  44.98 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  44.76 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  44.76 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  45.87 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  44.76 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  50.83 
 
 		 491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  48.84 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  45.61 
 
 		 500 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  46.81 
 
 		 453 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  47.01 
 
 		 464 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  47.85 
 
 		 449 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  46.97 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  46.59 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  44.48 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  50.18 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  45.96 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  47.42 
 
 		 458 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  46.81 
 
 		 467 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  46.33 
 
 		 449 aa  266  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  46.93 
 
 		 463 aa  265  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  45.13 
 
 		 474 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>