More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0571 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  82.96 
 
 		 270 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  78.97 
 
 		 276 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  76.71 
 
 		 267 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  73.33 
 
 		 271 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  70.3 
 
 		 268 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  70.98 
 
 		 267 aa  362  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  57.83 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  58.59 
 
 		 267 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  58.17 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.76 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  58.94 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  56.56 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  57.49 
 
 		 274 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  54.77 
 
 		 252 aa  275  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  58.61 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  57.03 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.28 
 
 		 324 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 		 282 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  56.45 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  55.46 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  54.76 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  59.17 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  57.68 
 
 		 246 aa  255  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  54.77 
 
 		 246 aa  252  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  51 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  51 
 
 		 304 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  51 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  56.63 
 
 		 259 aa  248  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  53.16 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  49.2 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  48.77 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  47.45 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  47.43 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  47.74 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.02 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.41 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  54.59 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  47.47 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  48.35 
 
 		 278 aa  218  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  48.25 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  46.92 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  53.92 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  47.89 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  54.98 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.64 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  45.45 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  47.27 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  54.5 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.32 
 
 		 258 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.21 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  45.23 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.06 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  46.32 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.53 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  48.29 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  48.07 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.63 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.28 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.06 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.96 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.22 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  44.79 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.35 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.14 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.63 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.56 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45.89 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  45.14 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.63 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.29 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  49.34 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  44.62 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1261  ABC transporter related  53.09 
 
 		 257 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192421  normal  0.0152402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  45.68 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.27 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.26 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  48.25 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  46.99 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.83 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  46.36 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.05 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  47.04 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>