129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0620 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  86.82 
 
 		 763 aa  1333    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 759 aa  1513    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  25.37 
 
 		 728 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  25.22 
 
 		 728 aa  134  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  25.22 
 
 		 728 aa  134  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  30.21 
 
 		 831 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  27.71 
 
 		 998 aa  98.6  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  27.11 
 
 		 939 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  31.91 
 
 		 1886 aa  95.1  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  27.7 
 
 		 1369 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  26.76 
 
 		 972 aa  91.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  27.33 
 
 		 983 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.37 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  26.46 
 
 		 1068 aa  80.9  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.09 
 
 		 1242 aa  79.7  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  29.01 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.21 
 
 		 1489 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  28.14 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.7 
 
 		 629 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  27.56 
 
 		 985 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1503  autotransporter beta-domain-containing protein  23.4 
 
 		 1069 aa  68.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  25.23 
 
 		 2848 aa  67.4  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.52 
 
 		 3015 aa  67.4  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  26.89 
 
 		 10429 aa  67.4  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  25.63 
 
 		 1677 aa  67  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  28.52 
 
 		 629 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  27.56 
 
 		 1011 aa  66.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  23.68 
 
 		 1001 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 994 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  29.02 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  24.89 
 
 		 1066 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  27.24 
 
 		 974 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.12 
 
 		 1673 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.66 
 
 		 641 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  27.8 
 
 		 629 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  26.53 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  25.38 
 
 		 995 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.18 
 
 		 1769 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  27.24 
 
 		 954 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.17 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.48 
 
 		 980 aa  58.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  23.99 
 
 		 1004 aa  58.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  23.99 
 
 		 1033 aa  57.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  25.31 
 
 		 991 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  29.31 
 
 		 2396 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  22.8 
 
 		 1001 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.38 
 
 		 3152 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  25.24 
 
 		 658 aa  56.6  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.45 
 
 		 1358 aa  56.2  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.61 
 
 		 995 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  24.48 
 
 		 684 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  25.98 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  23.53 
 
 		 1055 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  24.45 
 
 		 1179 aa  55.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  24.62 
 
 		 986 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  24.64 
 
 		 638 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  24.64 
 
 		 638 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  22.62 
 
 		 684 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.98 
 
 		 1154 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.42 
 
 		 814 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  27.93 
 
 		 646 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  23.95 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  25 
 
 		 765 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.64 
 
 		 638 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.29 
 
 		 2302 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.29 
 
 		 1865 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.69 
 
 		 1953 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3845  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.02 
 
 		 826 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  23.38 
 
 		 1025 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.29 
 
 		 1842 aa  52.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  24.16 
 
 		 730 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  25.54 
 
 		 3506 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  24.77 
 
 		 1078 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  22.74 
 
 		 1038 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.35 
 
 		 1285 aa  51.2  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  27.37 
 
 		 646 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  24.51 
 
 		 1672 aa  50.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.87 
 
 		 729 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  27.35 
 
 		 1062 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.81 
 
 		 1048 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  24.77 
 
 		 1222 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  26.17 
 
 		 3954 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  27.92 
 
 		 2366 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  26.1 
 
 		 2371 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  32.19 
 
 		 759 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  27.66 
 
 		 732 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3954  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.69 
 
 		 1348 aa  48.5  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  27.33 
 
 		 636 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  27.03 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.47 
 
 		 913 aa  48.5  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.81 
 
 		 960 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.37 
 
 		 1004 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  27.57 
 
 		 647 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.25 
 
 		 816 aa  47.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  25.47 
 
 		 882 aa  47.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  26.87 
 
 		 1152 aa  47.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  26.07 
 
 		 714 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  26.18 
 
 		 465 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  29.66 
 
 		 759 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  29.66 
 
 		 759 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>