97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5117 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  65.02 
 
 
646 aa  857    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 
636 aa  1295    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  60.47 
 
 
629 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  60.63 
 
 
629 aa  739    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  62.67 
 
 
640 aa  810    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  65.65 
 
 
646 aa  837    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  60.16 
 
 
629 aa  733    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  62.36 
 
 
640 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  60.03 
 
 
626 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.52 
 
 
617 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  25.15 
 
 
630 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 
628 aa  147  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  28.29 
 
 
594 aa  144  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  24.89 
 
 
628 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  25.98 
 
 
597 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  25.82 
 
 
597 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  28.61 
 
 
662 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  27.03 
 
 
647 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  28.61 
 
 
656 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  27.9 
 
 
656 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  27.9 
 
 
656 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  28.49 
 
 
349 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  28.62 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  24.24 
 
 
664 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  28.89 
 
 
337 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  28.43 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  29.32 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  26.22 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  26.22 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.8 
 
 
641 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.84 
 
 
629 aa  74.3  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  22.54 
 
 
684 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  26.67 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  27.53 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  26.68 
 
 
366 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.97 
 
 
330 aa  69.7  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  26.28 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  27.33 
 
 
347 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  23.06 
 
 
684 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.7 
 
 
1012 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.26 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  28.88 
 
 
347 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  25.97 
 
 
309 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
347 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  25.97 
 
 
309 aa  61.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.01 
 
 
2302 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  25.17 
 
 
1068 aa  57.4  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  28.87 
 
 
1677 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.59 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  28.06 
 
 
1025 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.86 
 
 
1842 aa  54.7  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  24.02 
 
 
317 aa  54.7  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.67 
 
 
3015 aa  54.7  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.05 
 
 
1865 aa  54.3  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  25.95 
 
 
379 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  25.95 
 
 
379 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  25.95 
 
 
379 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  25.66 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  25.66 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  25.66 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  25.66 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.67 
 
 
1953 aa  53.9  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  23.29 
 
 
939 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  24.87 
 
 
316 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.31 
 
 
723 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  25.66 
 
 
379 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  25.71 
 
 
339 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  24.83 
 
 
995 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.47 
 
 
816 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.82 
 
 
913 aa  52  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.58 
 
 
774 aa  52  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  24.41 
 
 
607 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.64 
 
 
915 aa  51.2  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  23.53 
 
 
317 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  27.33 
 
 
759 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  25.36 
 
 
341 aa  48.9  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  22.67 
 
 
1369 aa  48.5  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  23.23 
 
 
454 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  27.83 
 
 
372 aa  47.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  22.5 
 
 
972 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.37 
 
 
3152 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  26.74 
 
 
728 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  30.46 
 
 
429 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  26.74 
 
 
728 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.85 
 
 
1227 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  26.74 
 
 
728 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  25.5 
 
 
315 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  21.26 
 
 
326 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  27.02 
 
 
320 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.97 
 
 
375 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  23.42 
 
 
1011 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  23.36 
 
 
1222 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.31 
 
 
763 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  22.56 
 
 
983 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  24.39 
 
 
658 aa  43.9  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  23.91 
 
 
986 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  26.78 
 
 
375 aa  43.9  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>