102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0104 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  100 
 
 		 268 aa  547  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  33.67 
 
 		 628 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.33 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  32.2 
 
 		 594 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  32.62 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  31.9 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  30.16 
 
 		 628 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.87 
 
 		 617 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  30.38 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  29.05 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  30.1 
 
 		 597 aa  105  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  28.83 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  29.07 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  28.38 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  30.86 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.43 
 
 		 418 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  29.24 
 
 		 597 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  29.87 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  31.25 
 
 		 647 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  29.85 
 
 		 340 aa  95.9  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0175563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  29.1 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  30.03 
 
 		 372 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  30 
 
 		 454 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  29.93 
 
 		 339 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  31.45 
 
 		 320 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  38.71 
 
 		 584 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  38.56 
 
 		 656 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  37.91 
 
 		 656 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  28.89 
 
 		 375 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  26.58 
 
 		 329 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  26.58 
 
 		 329 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  28.67 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  28.32 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  28.62 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  28.62 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  29.22 
 
 		 630 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.78 
 
 		 375 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  25.83 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  38.56 
 
 		 656 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  29.24 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.34 
 
 		 418 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  25.45 
 
 		 418 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  29.8 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  28.57 
 
 		 646 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  25.71 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  33.65 
 
 		 662 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  28.18 
 
 		 516 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  28.18 
 
 		 516 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  29.41 
 
 		 640 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  28.21 
 
 		 646 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  29.62 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  29.94 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  29.2 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  27.22 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  27.22 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  27.22 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  27.22 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  27.22 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  27.22 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  27.22 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  29.93 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1297  GDSL family lipase  24.84 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.306833  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  24.84 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  26.67 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  24.84 
 
 		 433 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  28.3 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  28.3 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  25.54 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.99 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  28.97 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  28.92 
 
 		 629 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  26.8 
 
 		 610 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  26.8 
 
 		 610 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  26.8 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  26.8 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  26.8 
 
 		 610 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  26.8 
 
 		 610 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  26.8 
 
 		 610 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  26.9 
 
 		 627 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  22.51 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09442  cellulose-binding GDSL lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00510)  27.17 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.402908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  25.45 
 
 		 723 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  22.51 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  26.73 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  26.1 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  25.71 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  26.5 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  26.5 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  23.53 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  24.44 
 
 		 408 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  24.44 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  23.27 
 
 		 403 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1397  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  26.58 
 
 		 538 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0133  GDSL family lipase  23.88 
 
 		 380 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  23.37 
 
 		 408 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  23.4 
 
 		 408 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  22.79 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  24.06 
 
 		 408 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  23.4 
 
 		 408 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  23.71 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>